Co je to proximální promotor?

Proximální promotor je oblast v deoxyribonukleové kyselině (DNA) těsně před začátkem genu, kde se proteiny a jiné molekuly vážou při přípravě ke čtení tohoto genu.Promotorová oblast je nezbytná pro čtení a přepisování do proteinu, a to jak v jednoduchých prokaryotických buňkách, tak v komplexnějších eukaryotech.Řada proteinů zvaných transkripční faktory se vážou na DNA v této oblasti a provádějí mnoho úkolů připravujících se na transkripci genu.Nejdůležitějším z těchto funkcí je budování lešení proteinů, které drží DNA otevřenou a přepisuje správný gen současně.Prokaryotické buňky, buňky bez jádra, obvykle mají jeden typ promotoru, zatímco eukaryotické buňky, buňky se skutečným jádrem, mají další.Promotory obvykle leží několik nukleotidů proti proudu nebo dříve genu, který řídí.Téměř každý promotor obsahuje speciální sekvenci nukleotidů, které jej jako takové identifikují.Obecně platí, že prokaryotické promotory jsou identifikovány skupinou nukleotidů nazývaných sekvence Shine-Dalgarno a eukaryotické promotory jsou identifikovány specifickou genetickou sekvencí nazývanou Tata Box.může je vytvořit identifikaci a geny, které řídí, poněkud obtížné.Vzdálenost mezi promotorem a jeho genem není fixována uvnitř druhu nebo v rámci jediného organismu, takže určení, kde sedí ve vztahu k sobě, není triviální.Proximální složení sekvence proximálního promotoru nejsou vždy identické;Mohou velmi na délku, složení nebo obojí.Kromě toho mají markerové sekvence krabice Shine-Dalgarno nebo Tata Box určitou variabilitu.To, jak rozmanité transkripční faktory rozpoznávají promotory tváří v tvář této vlastní variabilitě, není snadné určit a nové příklady se často zdají zpochybnit tato dříve robustní řešení.Jeho proximální proximální promotor by mohl být ovlivněn působením blízkého genu.Někdy se to provádí záměrně v genomu, možná stimulovat více genů najednou nebo regulovat jejich působení současně.Jindy se propojení mezi dvěma geny prostřednictvím aktivity promotorů provádí omylem.Aby se zabránilo tomuto křížení mezi geny, kde to není zaručeno, mají některé genomy mezi sebou izolátorové oblasti.Tato zvláštní oblast není vždy nutná a některé genomy zabraňují křížovému pohledu na umístění genu jinými způsoby, jako je nutit jeden gen, aby byl neaktivní, zatímco druhý je aktivní.