Co je to ubikvitinační test?

Ubikvitinace označuje vazbu proteinového ubikvitinu na jiné proteiny třemi různými enzymy.Test ubikvitinace je test, který určuje, kolik z tohoto procesu dochází v buňce.Testy mohou být použity k určení toho, jak různé podmínky ovlivňují vazbu proteinu, kroky a struktury, které jsou důležité v ubikvitinnační dráze a množství proteinu v buňce.Nedostatečná nebo přílišná částka byla spojena s rozvojem mnoha různých onemocnění.

Protein nalezený v buňkách, funkcí ubikvitinu je vázat se na proteiny, zatímco funguje jako značka nebo signál k jiným strukturám.Tato značka pak signalizuje enzymy, aby vědělo, že protein může být zničen, recyklován nebo přesunut.Výsledkem je destrukce nebo přeprava proteinů.

Tyto značkovací proteiny jsou důležité pro opravu DNA, virové infekce a imunitní odpověď.Mezi další důležité funkce patří role v buněčné smrti, buněčné dělení a vývoj buněk.Příliš mnoho ubikvitinu nebo jeho nedostatku může hrát roli při tvorbě mnoha nemocí, jako je rakovina, genetické poruchy a nemoci imunitního systému.

Vědci použijí ubikvitinační test, aby se pokusili zjistit, které podmínky mění koncentraci proteinu v buňce a porovnávají nemocné buňky se zdravými buňkami.Vědci to také používají ke zkoumání, jaké podmínky způsobí změny vazby.Kromě toho se mohou pokusit propojit specifický kód DNA s množstvím enzymů v buňce.Jeden určí procento proteinů, které jsou vázány ubikvintinem.Další zkoumá aktivitu enzymů nebo přítomnost jiných meziproduktů nalezených v ubiquinované dráze.Různé testy jsou vyvinuty na základě cílového proteinu, na který se ubikvitin váže.

Základem testu ubikvitinace je začlenit sloučeninu, která je označena pomocí jiné snadno měřené chemikálie.V onkologických testech může být ubikvitin označen kryptátem, sloučeninou, která obsahuje dva atomy dusíku.To lze použít k určení, který enzym je v buňce nejaktivnější.

Ubikvitinační test bude mít dva kroky.Prvním je enzymatický krok, kde enzymy vážou značený ubikvitin na cílový protein.Druhým je detekční krok, ve kterém je zkoumána vazba cílového proteinu pomocí konjugátu, jako je protilátka.Protilátka bude fluoresces nebo změní barvu, která pak umožňuje výzkumníkovi určit aktivitu enzymů.