Skip to main content

Jak byl lidský genom sekvenován?

Lidský genom byl sekvenován dvěma různými skupinami dvěma různými způsoby.Projekt Human Genome Project USD (USD) 3 miliardy USD (USD) (HGP), podporovaný ministerstvem energetiky USA, použil techniku hierarchické sekvenování brokovnice, kde rozložil lidský genom na kusy, které se skládají ze 150 000 párů základních párů.Tyto kusy byly poté umístěny do bakterií, kde bakterie replikační stroje DNA vytváří mnoho kopií vzorku pro snadnější sekvenování.Tyto konstrukty se nazývají bakteriální umělé chromozomy.Projekt byl založen v roce 1990 a dokončil 13 let, dosáhl svého konce v dubnu 2003. Hrubý návrh lidského genomu byl k dispozici v dubnu 2000.

Další skupina, Celera Genomics, použila relativně nový přístup s názvem celý genomový brokovniceSekvenování sekvence lidského genomu za mnohem kratší dobu a za mnohem nižší ceny (300 milionů USD) než federálně financovaný HGP.Tato skupina začala v roce 1998 a byla dokončena v roce 2001. Celé sekvenování brokovnice zahrnuje rozbití více kopií genomu do menších částí náhodně, sekvenování těchto částí a poté určování, které části se spojují, s nimiž se vidí, kde se kodony překrývají.Algoritmy superpočítadla a sekvenování přispěly neocenitelně k přístupu Celera, což je proveditelné.Před prací Celeras byl největší genom sekvenovaný celým brokovnicovým přístupem asi 13 milionů párů bází, daleko od lidských genomů tři miliardy párů bází.Je důležité si uvědomit, že projekt Celera nezačal od nuly, jak to udělal HGP;Dokázal získat přístup k existujícím informacím, které byly dříve zveřejněny na GenBank, sbírce genetických sekvencí a dat dostupných všem.Junk DNA), vytvoření celkem asi 25 000 genů.To je malé ve srovnání s odhady 40 000 až 2 000 000 genů, které se před dokončením projektu házejí.Konečnost lidského genetického kódu znamená, že je možné, že jednoho dne budou vědci schopni porozumět lidským genům v celém rozsahu a dokonce s nimi manipulovat.

Práce pokračuje v analýze práce, která vyšla z HGP.Nejnovější iniciativou je najít způsob, jak sekvenovat lidský genom za méně než 1 000 USD, což by technologii provedila pro širší použití.Jediné sekvenování by mohlo určit mnoho důležitých genetických charakteristik osoby, včetně vaší pravděpodobnosti rozvoje určitých nemocí.Craig Venter, bývalý vůdce projektu Celera, nechal svůj genom zcela sekvenován a hovořil s různými médii o výsledcích a jejich důsledcích.