Skip to main content

Co je to v biologii konsensuální sekvence?

Konsenzuální sekvence je sada proteinů nebo nukleotidů v deoxyribonukleové kyselině (DNA), která se objevuje pravidelně.Aminokyseliny adenin, guanin, cytosin a thymin tvoří genetické sekvence v DNA.Molekulární biologové často používají statistiku k predikci, kde bude určitá jejich sekvence, nebo aby pochopila, kde se konkrétní molekuly váže.Tam, kde aminokyselinové sekvence zůstávají stejné a tam, kde mají tendenci se lišit, mohou být reprezentovány vzorcem.V případě sekvence promotoru konsensu se může konkrétní typ enzymu vázat na místa podobně sekvenovaných proteinů.V těle je tolik aminokyselin a genů, že je vědci nemohou spočítat, pokud k tomu neexistuje nějaký obecný systém.Sekvence konsensu se může objevit na mnoha místech v DNA i v různých živých věcech.Podobnosti a rozdíly, ke kterým dochází, mohou být indikovány vzorcem.

Statisticky mohou vědci klasifikovat genetické sekvence, aby hledali vzory.Opakující se vzory, nazývané sekvenční motivy, se obecně používají k reprezentaci genetických oblastí, které řídí specifické biologické procesy.Konsenzuální sekvence mohou také nabídnout vhled do toho, jak jsou proteiny syntetizovány nebo jak jsou molekuly vedeny v buňce.Lze také naznačit, že tam může být jeden nebo druhý nukleotid.V tomto případě, jak často se objevuje aminokyselina místo jiného, obecně není uvedeno.Grafický model se někdy používá k označení této frekvence zvýšením nebo snižováním velikosti symbolů.Některé softwarové programy mohou generovat sekvenční loga automaticky.

Konsenzuální sekvence se často shoduje s uznávaným vazebným místem proteinu.K přesnému zobrazení sekvencí na genomu se často používají matematické vzorce.Patří mezi ně statistické vzorce, jako jsou logaritmy a numerické hodnoty, které mohou být pozitivní nebo negativní, reprezentovat umístění genetických informací.Procesy v genomu pro normální biologické funkce, stejně jako procesy související s nemocemi, lze analyzovat tímto způsobem.Přesný obrázek není obvykle poskytnut.Sekvence však mohou vědcům pomoci spojit funkční aspekty různých částí genomu s evolučními vzory organismů.