Co je to syntetický peptid?

Peptidy jsou organické molekuly, ve kterých je více aminokyselin spojeno peptidovými vazbami.Každá aminokyselina má jiný postranní řetězec.Všechny aminokyseliny se skládají z amino skupiny, která je NH2, a karboxylátové skupiny, což je COOH.Když tyto skupiny reagují, vytvářejí peptidovou vazbu.Při chemickém provádění mimo buňku je peptid známý jako syntetický peptid.

Dipeptid obsahuje dvě aminokyseliny a má jednu peptidovou vazbu, zatímco tripeptid má tři aminokyseliny a dvě peptidové vazby.Konvencí je, že aminokyselinové řetězce až 50 aminokyselin jsou známé jako peptidy, zatímco ty delší jsou známé jako proteiny.Hlavní rozdíl ve výrobě syntetického peptidu spočívá v tom, že aminokyseliny se přidávají z karboxylátových skupin vpřed.V buňkách ribosomy začínají syntetizovat peptidy s amino skupinou.To umožňuje tvorbu syntetického peptidu, který by se nevyskytl v přírodě, jako jsou ty obsahující nepřirozené aminokyseliny.Touto metodou jsou na porézních kuličkách imobilizovány peptidové řetězce.Aminokyseliny jsou ošetřeny ochrannými skupinami FMOC nebo BOC, aby je chránily před nežádoucími reakcemi.

Peptidy podléhají opakovaným cyklům vazby a detekce.Při nechráně má peptid připojený k pevné fázi volnou amino-terminální skupinu, která je spojena s aminokyselinovou jednotkou chráněnou dusíkem.Poté je tato jednotka deprotekována a může dále reagovat na připojení další aminokyseliny.Jakmile je peptid dokončen, je štěpen z pryskyřice a purifikován HPLC s reverzní fází.Proces vytvářející syntetický peptid může být uzavřen řadě společností.

Syntéza peptidů se provádí pro různé cíle výzkumu.Někteří vědci si přejí ověřit, že správně určili strukturu přirozeně se vyskytujících peptidů.Jiní provádějí studie struktury/funkcí na biologicky aktivních proteinech a peptidech.Takové peptidy zahrnují hormony a řada toxinů.Syntetické peptidy se často používají jako sondy ke studiu aktivních částí proteinových molekul.Každý protein se rozpadne na vzorec jedinečných peptidů, které lze detekovat hmotnostní spektrometrií.Proces výroby protilátek na proteiny u zvířat se s příchodem peptidové syntézy stal mnohem jednodušší.Člověk nemusí pracně čistit protein a používat jej ke generování protilátek.Jeden může syntetizovat peptid s fragmentem proteinu a poté použít tento peptid jako zdroj protilátek.Syntéza peptidů se používá k generování knihoven peptidů pro screening pro jejich biologické vlastnosti.Byly vyvinuty peptidy pronikavé buňky, které mohou do buněk zavést různé faktory, včetně peptidů, proteinů a stavebních bloků DNA.Takové techniky mají velký potenciál jako systémy dodávání léčiv.