Co je to transkriptom?

Transcriptom je úplná sbírka RNA z organismu, skupiny buněk nebo dokonce specifické buňky.RNA je syntetizována z DNA prostřednictvím procesu známého jako transkripce.RNA přítomná v buňce a těle určuje, které geny budou exprimovány, a změní se v průběhu organismů na rozdíl od DNA, která zůstává statická.Tlak prostředí je jedním z hlavních důvodů změn, protože se tělo pokouší přizpůsobit se měnícím se životním prostředí, aby se fungoval.Jednoduše řečeno, dalo by se myslet na DNA jako na kuchařku a uvádět kompletní sbírku receptů, které lze vyrobit.Přepis je kód, který určuje, které recepty budou vyrobeny a kdy.Kuchařka zůstává po celý život statická, zatímco přepisová se mění v reakci na environmentální faktory.

Jednou z důležitých součástí transkriptomu jsou molekuly mRNA.Messenger RNA je RNA, která komunikuje s ribozomy v buňkách, aby nasměrovala buňky, aby vytvořily různé proteiny.Tyto proteiny se používají pro širokou škálu funkcí.Jiné části nemusí přímo kódovat produkci proteinů, ale dělají věci, jako je stanovení buněčné struktury a regulace genové exprese.Společně různé složky transkriptomu udržují fungování organismu a určují genovou expresi v tomto organismu.

V různých buňkách v těle se transkriptom může velmi lišit.Například jaterní buňky mají RNA, která z nich činí jaterní buňky a zajišťuje, že buňky provádějí nezbytné funkce.Na druhé straně kožní buňky mají jiný transkript, který aktivuje geny nezbytné k tomu, aby se buňka stala buňkou kožní.Játra i kožní buňky mají kompletní kopii genomu, ale jejich transkriptomy určují, které části genomu jsou aktivovány.

Stejně jako u DNA je možné sekvenovat RNA.Sekvenování transkriptomu lze provést, abyste se dozvěděli více o akcích buňky a hostitelských organismů DNA a pro identifikaci míst, kde se výraz genetických informací pokazí.Když se například jaterní buňka stane maligní, je to proto, že transkriptom nefunguje tak, jak by měl být, a geny pro malignitu byly aktivovány nebo buňky nějakým způsobem postrádají regulaci, což způsobuje, že vyrůstají z kontroly.Sekvenování RNA v maligní buňce může vědci pomoci zjistit, který gen byl aktivován nebo inaktivován, aby způsobil malignitu.