Co je anotace genomu?

Genomová anotace označuje sekce genomu s informacemi o genetických datech, které obsahuje.Toto je součást procesu na projektech genomu, kde cílem není pouze sekvence DNA cílového organismu, ale také pochopit, co dělá a jak funguje.Vědci mohou ve svých laboratořích provádět anotaci a mohou sdílet data s ostatními vědci, aby sdružili zdroje a informace.K dispozici jsou online databáze otevřené veřejnosti a některé také umožňují členům veřejnosti předložit své vlastní anotace.Sekvenování celého genomu trvá dlouho a je běžné, že vědci zahájí anotaci před dekódováním genomu.S částí sekvenované DNA v ruce může výzkumník začít anotovat.Vědci si mohou všimnout, kde se zdá, že geny začínají a zastavují, a věnují pozornost charakteristickým řetězcům DNA, které obsahují informace o funkci genomu.

Počítače jsou schopny provádět určitou anotaci genomu samy o sobě.Mohou hledat známé vzorce, jako jsou řetězce aminokyselin, které se objevují na začátku a na konci genů.V automatizované anotaci může počítač přidat poznámky do různých částí řetězce DNA, aby o něm poskytl informace.Je také možné porovnat segmenty z různých organismů a hledat rozptyl, které by mohly poskytnout důležité informace o druhu jako celku.Mnoho vědců používá počítače k zobrazení informací a označení je, což jim umožňuje zadat do databází, jak fungují.V některých případech může být po automatizované anotaci nezbytná ruční kontrola, aby se zajistilo, že počítač má informace o správném stavu.To může být pečlivý proces a dochází k chybám, což je jeden z důvodů, proč vědci rádi sdružují databáze.Pokud anotace neodpovídá ostatním ve stejné části DNA, mohou lidé vyhodnotit informace, aby zjistili, co se stalo, a opravit chybu.

Není vždy možné určit, co gen dělá během procesu anotace genomu.Vědci mohou označit geny a oddělit je od jiných složek genomu, jako jsou nekódující DNA, jako jsou opakování.Tyto informace lze použít ve výzkumu, protože lidé vyvíjejí teorie o různých segmentech genomu.Mohou přidat k anotacím, aby si všimli funkce genu