Co je polymorfismus délky fragmentu restrikčního fragmentu?

Polymorfismus délky fragmentu restrikčního fragmentu, neboli RFLP, je změnou homologních sekvencí DNA.Polymorfismy jsou změny v homologní DNA, které se vyskytují mezi jednotlivci, zatímco termín omezení se týká skutečnosti, že malé části DNA lze vyříznout z velkého kusu pomocí restrikčních enzymů.Některé řezy DNA mají větší variabilitu než jiné a řezy s vysokou variabilitou jsou užitečné při analýze polymorfismu restrikční délky fragmentu.

Polymorfismus délky fragmentu restrikčního fragmentu se spoléhá na aktivitu restrikčních endonukleáz.Tato třída enzymu se nachází u mnoha bakteriálních druhů.V bakterii je úlohou restrikčních endonukleáz poskytovat ochranu proti cizí DNA, která získává přístup, rozdělením na kusy.V molekulárním výzkumu mohou být restrikční enzymy použity k fragmentaci DNA na známých místech variability, takže výsledné fragmenty lze analyzovat.kde to rozpoznává sekvenci.Bakterie chrání svou vlastní DNA před porušováním výrazného vzoru methylace DNA, který zabraňuje vazbě endonukleáz restrikcí.Bylo objeveno více než 800 různých restrikčních endonukleáz, které společně rozpoznávají více než 100 jedinečných nukleotidových sekvencí.Většina rozpoznaných sekvencí je mezi čtyřmi a šesti párůmi bází.Enzymy se používají ke snížení délky DNA v určitých sekvencích, takže lze prozkoumat rozdíly mezi jednotlivci.Roztoky fragmentované DNA, řezané v určitých známých nukleotidových sekvencích, jsou hybridizovány sondami určenými k detekci předdefinovaných sekvencí DNA.Vzorky jsou poté analyzovány pomocí gelové elektroforézy.Tato technika vytváří gel s více pásy tmavého barvení, z nichž každý představuje odlišný fragment DNA.Zkoumáním vzorce barvení mohou vědci určit vzorec RFLP přítomných ve vzorku.

Polymorfismy se široce vyskytují v lidském genomu a jejich analýza prokázala, že různé skupiny lidí mají tendenci sdílet RFLP společné.Některé typy RFLP jsou běžné pro lidi různých etnických skupin nebo například geografického původu a propojení také existuje v rodinných skupinách.Tato variace existuje v celém království zvířat, což z něj činí užitečný výzkumný nástroj nejen pro sledování lidského původu, ale také pro studium migrace a vývoje volně žijících živočichů.Polymorfism sondy restrikční fragmenty se používají v otcovských testech, v diagnostice dědičných onemocnění, ve forenzní vědě a v genotypizaci.Analýza vzorců RFLP v celém genomu je základem otisku prstu DNA, techniky, která je podporou všech těchto různých použití.