Hvad er en proximal promotor?

En proksimal promotor er en region i deoxyribonukleinsyre (DNA) lige før begyndelsen af et gen, hvor proteiner og andre molekyler binder som forberedelse til at læse dette gen.Promotorregionen er vigtig for, at de fleste gener kan læses og transkriberes til protein, i både enkle prokaryotiske celler og de mere komplekse eukaryoter.En række proteiner kaldet transkriptionsfaktorer binder til DNA'et i denne region, og de udfører mange opgaver, der forbereder sig til gentranskription.Det vigtigste af disse funktioner er at opbygge et stillads af proteiner, der holder DNA åbent og transkriberer det rigtige gen på samme tid.

Den nøjagtige placering og struktur af en proximal promotor varierer mellem gener og celletyper.Prokaryotiske celler, dem med ingen kerne, har normalt en type promotor, mens eukaryote celler, dem med en ægte kerne, har en anden.Promotorer ligger normalt et par nukleotider opstrøms for eller før genet, de kontrollerer.Næsten enhver promotor indeholder en speciel sekvens af nukleotider, der identificerer det som sådan.Generelt identificeres prokaryotiske promotorer af en gruppe nukleotider kaldet glans-dalgarno-sekvensen, og eukaryotiske promotorer identificeres ved en bestemt genetisk sekvens kaldet Tata-boksen.

På trods af disse relativt enkle regler følger ikke hver proksimal promotor dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, som følger dem, hvilke derkan gøre at identificere dem og de gener, de kontrollerer, lidt vanskelige.Afstanden mellem en promotor og dets gen er ikke fastgjort inden for en art eller inden for en enkelt organisme, så det er ikke trivielt at bestemme, hvor de sidder i forhold til hinanden.Proximale promotorsekvenssammensætninger er ikke altid identiske;De kan meget i længde, sammensætning eller begge dele.Derudover har markørsekvenserne i Shine-Dalgarno-boksen eller Tata-boksen en vis variation i dem.Hvordan de forskellige transkriptionsfaktorer genkender promotorer i lyset af denne iboende variation er ikke let at bestemme, og nye eksempler vises ofte, der sætter spørgsmålstegn ved disse tidligere robuste løsninger.

Når et gen er meget tæt på et andet gen, findes muligheden for detDens proksimale promotor kunne blive påvirket af virkningen af det nærliggende gen.Nogle gange gøres dette med vilje i genomet, måske for at stimulere flere gener på én gang eller regulere deres handling samtidig.På andre tidspunkter udføres en forbindelse mellem to gener gennem en promotoraktivitet ved en fejl.For at forhindre denne krydstale mellem gener, hvor det ikke er berettiget, har nogle genomer isolatorregioner mellem dem.Denne ekstra region er ikke altid nødvendig, og nogle genomer forhindrer krydstale ved genpositionering på andre måder, som at tvinge et gen til at være inaktiv, mens et andet er aktivt.