Hvad er en konsensus -sekvens?

En konsensus -sekvens er et sæt proteiner eller nukleotider i deoxyribonukleinsyre (DNA), der vises regelmæssigt.Aminosyrerne adenin, guanin, cytosin og thymin udgør genetiske sekvenser i DNA.Molekylære biologer bruger ofte statistikker til at forudsige, hvor en bestemt sekvens af dem vil være, eller for at forstå, hvor bestemte molekyler har en tendens til at binde.Hvor aminosyresekvenserne forbliver de samme, og hvor de har tendens til at variere, kan der repræsenteres ved en formel.I tilfælde af en konsensuspromotorsekvens kan en bestemt type enzym binde til steder med lignende sekventerede proteiner.

Genetikere, som forskere i mange videnskabelige discipliner, bruger ofte substitutioner til at forenkle komplekse systemer.Der er så mange aminosyrebaser og gener i kroppen, at forskere ikke kan tælle dem, medmindre der er et generelt system til at gøre det.En konsensus -sekvens kan også vises mange steder i DNA i forskellige levende ting.De ligheder og forskelle, der har tendens til at forekomme, kan indikeres med en formel.

Statistisk kan forskere klassificere genetiske sekvenser for at se efter mønstre.Gentagne mønstre, kaldet sekvensmotiver, bruges generelt til at repræsentere genetiske områder, der kontrollerer specifikke biologiske processer.Konsensus -sekvenser kan også give indsigt i, hvordan proteiner syntetiseres, eller hvordan molekyler styres i en celle.

I notationen af en konsensus -sekvens kan placeringen af nogle nukleotider vise, at de altid er på det repræsenterede sted.Det kan også indikeres, at det ene nukleotid kan være der.I dette tilfælde, hvor ofte en aminosyre vises, i stedet for en anden, er generelt ikke angivet.En grafisk model bruges undertiden til at indikere denne frekvens ved at øge eller reducere størrelsen på symboler.Nogle softwareprogrammer kan generere sekvenslogoer automatisk.

Ofte matcher en konsensus -sekvens med et anerkendt proteinbindingssted.For nøjagtigt at skildre sekvenser på genomet bruges ofte matematiske formler.Disse inkluderer statistiske formler såsom logaritmer og numeriske værdier, som kan være positive eller negative, til at repræsentere placeringen af genetisk information.Processer i genomet for normale biologiske funktioner såvel som dem, der er relateret til sygdomme, kan analyseres på denne måde.

De matematiske repræsentationer af en konsensus -sekvens tilvejebringer generelt en model af DNA- og aminosyremønstre.Et nøjagtigt billede er typisk ikke leveret.Sekvenserne kan imidlertid hjælpe forskere med at relatere de funktionelle aspekter af forskellige dele af genomet til evolutionære mønstre af organismer.