Hvad er en contig?

En contig, forkortet for sammenhængende, henviser til enten en deoxyribonukleinsyre (DNA) -segment eller produktet af overlappende segmenter, der danner en kontinuerlig, omfattende, uafbrudt DNA -sekvens.Ved at studere kort over disse segmenter er det muligt at opdage rækkefølgen af segmenter, der omfatter forskellige sekvenser, og contigs kan tilføjes, fjernes eller omarrangeres for at danne nye sekvenser.DNA Contig -kortlægning og biblioteker giver forskere mulighed for at identificere justeringer, der kan forårsage sygdomme, give en bedre forståelse af, hvordan celler reagerer under visse betingelser, og muliggør evnen til at klone gunstige egenskaber i levende organismer.

Genomiske contigs er forbundet med en anden afOverlapning af matchende sekvensmærket sæt eller ved at matche udtrykte sekvensmærker.Ved at forstå denne byggesten, der bruges af baserne i DNA -segmenter, kan contigs replikeres eller klones i ønskelige sekvenser, hvilket tilføjer eller eliminerer mindre gunstige segmenter.Forskere ser disse sekvenser som kort på meget detaljerede, edb -DNA -programmer.Programmet tilvejebringer en visuel nedbrydning af de baser, der bruges til at konstruere segmenterne, og de segmenter, der bruges til at opbygge bestemte sekvenser.Ved hjælp af forskellige farveskemaer viser forskellige Contig -programmer disse oplysninger som lave, mellemstore og sekvenser af høj kvalitet.

Contig kortlægning kaster ofte lys over årsagerne til genetiske lidelser.Williams syndrom producerer for eksempel flersystemsymptomer hos børn, herunder hjerte-kar-problemer, forhøjede blodkalciumniveauer og manglende trives.Forskere opdagede bånddeletioner, der påvirker visse gener, som kan være forårsaget af upassende overlapning af contigs.En anden genetisk barndomsforstyrrelse, CRI-du-chat-syndrom, producerer også flere symptomer, som hver enkelt forskere mener korrelerer med sletninger og unormal positionering.

Forskere analyserer også contig -sekvenser i plantearter.Hver plante indeholder sekventering, der er unik for denne plante, og ved at opnå kort over individuelle plantearter opdager forskere lignende og forskellige egenskaber, der kan bidrage til sundhed eller forringelse af en bestemt plantetype.Ved at analysere contig -segmenter og sekvenser i sygdom, der bærer organismer, kan læger bestemme træk, som derefter kan bruges i behandlingsudvikling.Kortlægning giver visuel indsigt i mulige genetiske manipulationer gennem sekvensdeletioner eller kloning.

Forskere kan dyrke klonede DNA -prøver i bakterielt kunstigt kromosom, gær kunstigt kromosom eller i P1 eller fag kunstigt kromosommedie.Disse kromosomer indeholder overalt fra 50 til hundreder af tusinder af baser, der kompilerer contig -segmenter.Efter en periode med kolonisering ekstraheres prøver under anvendelse af en sprøjte og anbringes i DNA -sekventeringsgel, der gennemgår elektroforese og tørrer.En autoradiograf læser prøven og fingeraftryk sekvenserne.Forskere scanner derefter fingeraftrykket til en billedfil, som senere kan indlæses i et Contig -program.