Hvad er et peptidantigen?

Et peptidantigen er brugen af et peptid til at udløse et dyrs immunsystem til at udvikle antistoffer mod dette peptid.Peptider er korte strenge af aminosyrer;Længere kæder er kendt som proteiner.Et peptidantigen kan anvendes som en del af udviklingen af en vaccine.

Peptider er organiske molekyler bestående af nitrogen, ilt, kulstof, brint og normalt svovl.De er kæder af aminosyrer og er forbundet med en peptidbinding.Peptidbindinger er forbindelser af NH2- og COOH -grupperne af de to aminosyrer, der støder op til hinanden.

Et antigen er et molekyle, der binder til et antistof og genererer en immunrespons, kropsreaktionen på molekyler, der ser ud til at være fremmed.Ikke alle typer molekyler er i stand til at blive genkendt af immunsystemet.Proteiner, peptider og kæder af sukker kan fungere som antigener.

Der er også humane antigener.Disse inkluderer proteiner, der er til stede på overfladen af tumorceller.Sådanne antigener kan også være til stede i blodet.Dette er grundlaget bag udstratspecifik antigenprøvning, som ofte bruges til at screene til udbredelse af kræft.Nogle antigener introduceres med vilje for at fungere som vacciner og generere en immunrespons.

Antistoffer er proteiner i blodet, der modvirker et specifikt antigen.Kun nogle dele af et molekyle genkendes af et antistof.Spidsen af antistoffet indeholder en paratop, der genkender den komplekse struktur af antigenet.Denne region af antistoffet er ansvarlig for den store mangfoldighed af antistoffer, der er til stede i en organisme.En person kan have millioner af forskellige antistoffer.

Ofte anvendes peptidantigener, fordi de er en del af et større protein, som muligvis ikke er blevet oprenset.Når man bruger et peptidantigen til at fremstille antistoffer, er det vigtigt, at en forsker bruger et antigen afsnit af peptidet.Antigen -specialister kan hjælpe med antigendesign for at maksimere chancerne for, at peptidet, der anvendes som antigen, vil generere et antistof.Det er meget lettere at forudsige, hvilke epitoper der udsættes for, hvis man har kendskab til den tredimensionelle struktur af forbindelsen.

I de fleste tilfælde er der ingen viden om den overordnede struktur af peptidet, selvom forudsigelig software kan analysere, hvilket afsnit af peptidet sandsynligvis vil være antigene.De peptider, der mest sandsynligt støder på et antistof, er dem på overfladen af cellen.De er sandsynligvis hydrofile mdash;opløselig i vand.Fleksibilitet er også et vigtigt kriterium for et peptidantigen til at reagere med en epitop.

Når der er identificeret et passende peptidantigen, oprettes et syntetisk peptid.Det kan derefter bruges til immunisering.Det injiceres i et dyr for at generere en immunrespons.Når antistofferne er blevet isoleret, analyseres de for at sikre, at organismen har monteret en effektiv immunrespons.

En almindelig måde at teste for at se, om antistoffer er specifikke for det ønskede protein, er at udføre en vestlig blot.Dette involverer at adskille de proteiner, der indeholder peptidet på en gel ved hjælp af en elektrisk strøm.Dette kaldes elektroforese.Derefter overføres proteinerne til en membran og sonderes med antistoffet.

Hvis der er antistof, der er specifikt for proteinet, vil det binde til proteinet på membranen.Membranen vaskes og behandles derefter med et sekundært antistof.Hvis antistofferne blev udviklet i en mus, ville det sekundære antistof være et anti-mus-antistof.Dette antistof er konstrueret til at generere farve eller luminescens, så forskeren kan se, hvor det originale antistof har bundet.