Hvad er genomnotation?

Genomanotationskoder sektioner af et genom med information om de genetiske data, det indeholder.Dette er en del af processen ved genomprojekter, hvor målet ikke kun er at sekvensere DNA'et for en målorganisme, men at forstå, hvad det gør, og hvordan det fungerer.Forskere kan gennemføre annotation i deres laboratorier og kan dele data med andre forskere for at samle ressourcer og information.Online -databaser, der er åbne for offentligheden, er tilgængelige, og nogle tillader også medlemmer af offentligheden at indsende deres egne kommentarer.

Det første trin i genomnotation er sekventering, hvor forskere bestemmer rækkefølgen af aminosyrer i et organismer DNA.Sekventering af et helt genom tager lang tid, og det er almindeligt for forskere at starte annotering, før genomet er blevet afkodet.Med et afsnit af sekventeret DNA i hånden kan en forsker begynde at kommentere.Forskere kan bemærke, hvor gener ser ud til at starte og stoppe, og være opmærksomme på karakteristiske strenge af DNA, der indeholder information om genomets funktion.

Computere er i stand til at udføre en vis genom -annotation på egen hånd.De kan søge kendte mønstre, såsom strenge af aminosyrer, der vises i begyndelsen og slutningen af gener.I automatiseret annotation kan computeren tilføje noter til forskellige sektioner af en række DNA for at give information om det.Det er også muligt at sammenligne segmenter fra forskellige organismer for at se efter varians, der kan give vigtige oplysninger om arten som helhed.

Manuel genom -annotation involverer fysisk gennemgang af DNA'et.Mange forskere bruger computere til at vise informationen og mærke dem, så de kan indtaste dem i databaser, når de arbejder.I nogle tilfælde kan en manuel gennemgang være nødvendig efter automatiseret annotation for at sikre, at computeren fik informationen korrekt.Dette kan være en omhyggelig proces, og der forekommer fejl, hvilket er en af grundene til, at forskere kan lide at samle databaser.Hvis en annotation ikke stemmer overens med andre på den samme del af DNA, kan folk evaluere oplysningerne for at bestemme, hvad der skete, og fastsætte fejlen.

Det er ikke altid muligt at bestemme, hvad et gen gør under genom -annotationsprocessen.Forskere kan markere gener og adskille dem fra andre komponenter i genomet, såsom ikke-kodende DNA som gentagelser.Disse oplysninger kan bruges i forskning, når mennesker udvikler teorier om forskellige segmenter af genomet.De kan tilføje til kommentarerne for at bemærke funktionen af et gen.