Hvad er begrænsningsfragmentlængde polymorfisme?

En restriktionsfragmentlængde polymorfisme eller RFLP er en variation i homologe DNA -sekvenser.Polymorfismer er variationerne i homologt DNA, der forekommer mellem individer, mens udtrykket begrænsning henviser til det faktum, at små sektioner af DNA kan skæres fra et stort stykke ved hjælp af restriktionsenzymer.Nogle DNA -sektioner har mere variation end andre, og sektioner med en høj grad af variation er nyttige i restriktionsfragmentlængde polymorfismeanalyse.

Polymorfisme af begrænsningsfragmentlængde er afhængig af aktiviteten af begrænsningsendonukleaser.Denne klasse af enzym findes i mange bakteriearter.I en bakterie er rollen som begrænsningsendonukleaser at give beskyttelse mod udenlandsk DNA, der får adgang ved at opdele det i stykker.I molekylær forskning kan restriktionsenzymer bruges til at fragmentere DNA på kendte variationsteder, så de resulterende fragmenter kan analyseres.

Hver type enzym genkender en specifik DNA -basepar -sekvens, og virker for at spalte DNA -molekylet på ethvert tidspunkthvor den genkender sekvensen.Bakterier beskytter deres eget DNA mod at blive brudt med et karakteristisk mønster af DNA -methylering, der forhindrer, at begrænsningsendonukleaser er i binding.Mere end 800 forskellige begrænsningsendonukleaser er blevet opdaget, som tilsammen genkender mere end 100 unikke nukleotidsekvenser.Enzymerne bruges til at skære DNA -længder ved visse sekvenser, så forskellene mellem individer kan undersøges.Opløsninger af fragmenteret DNA, skåret ved visse kendte nukleotidsekvenser, hybridiseres med prober designet til at detektere foruddefinerede DNA-sekvenser.Prøverne analyseres derefter ved anvendelse af gelelektroforese.Denne teknik producerer en gel med flere bånd af mørk farvning, som hver repræsenterer et andet DNA -fragment.Ved at undersøge farvningsmønsteret kan forskere bestemme mønsteret af RFLP'er, der er til stede i en prøve.

Polymorfismer forekommer vidt i det humane genom, og analysen af disse har vist, at forskellige grupper af mennesker har en tendens til at dele RFLP'er til fælles.Visse RFLP -typer er for eksempel almindelige for mennesker i forskellige etniske grupper eller geografisk oprindelse, og sammenhæng findes også inden for familiegrupper.Denne variation findes i hele dyreriget, hvilket gør det til et nyttigt forskningsværktøj ikke kun til at spore menneskelig aner, men også til at studere migration og udvikling af dyreliv.Restriktionsfragmentlængde polymorfismeprober anvendes i faderskabstest, i diagnose af arvelige sygdomme, i retsmedicinsk videnskab og i genotyping.Analyse af mønstre af RFLP'er på tværs af et helt genom er grundlaget for DNA -fingeraftryk, teknikken, der er underbygningen af alle disse forskellige anvendelser.