Hvad er ribosomal RNA -sekventering?

Ribosomal ribonukleinsyre (RNA) sekventering er processen med at bestemme sekvensindholdet i nukleinsyrerne, der udgør ribosomet.I næsten alle celler er ribosomer makromolekyler, der bygger proteiner for at holde cellen i gang.De består af RNA og en række proteiner, der hjælper RNA med at arbejde mere effektivt.Meget af dette materiale i et ribosom er direkte involveret i proteinbygning, så bestemmelse af ribosomal RNA -sekventering kan give indsigt i den endelige struktur af molekylet, samt hvordan det fungerer.RNA's funktion og generelle struktur er godt konserveret mellem en række forskellige arter, men den rå sekvens er ikke, og ændringer i sekvensen kan bruges til at udlede information om ribosomerudviklingMere komplekse organismer, ribosomal RNA -sekventering opnås på en lignende måde.Når RNA er adskilt fra ribosomet, duplikeres det mange gange og opdeles derefter i små fragmenter, hvis sekvenser let kan identificeres.Disse små sekvensstykker samles derefter igen for at generere den nyligt bestemte sekvens.Opgaven bliver mere kompliceret, efterhånden som en sekvens bliver længere, men processen er stadig relativt let for ribosomalt RNA, som er relativt lille.Der er ingen garanti for, at et første forsøg på ribosomal RNA -sekventering vil være korrekt første gang, så flere forsøg på at verificere datakvaliteten udføres normalt.

De data, der er opnået fra ribosomal RNA -sekventering, kan bruges til forskellige formål, menEn af de mest almindelige er til bakteriel identifikation.Især bakteriel ribosomalt RNA er meget konserveret mellem arter, så sekventering tillader, at de unikke egenskaber ved en art konsolideres til en profil til reference.Denne profil kan bruges til hurtigt og nemt at identificere en bestemt type bakterier, en test, der kan hjælpe med diagnosen og behandlingen af de syge.Med fremkomsten af bedre sekventeringsteknologi er denne tilgang blevet mere almindelig i diagnoser.

En anden påvirkning af ribosomal RNA -sekventering kan have på menneskers sundhed er at hjælpe designet af lægemidler og medicin.Bakterielle ribosomale RNA -sekvenser har mange efterfølgende, der er unikke for bakterier, så målretning af disse regioner med antimikrobielle lægemidler kan dræbe bakterier uden at være skadelige for mennesker.Ribosomal RNA -sekventeringsdata på egen hånd leverer ikke nok data til at skabe medicin, men det giver forskere regioner at fokusere på til fremtidig undersøgelse og lægemiddeldesign.Medicinske molekyler kan konstrueres, der fastgøres til sekvenserne og deaktiverer ribosomet.En række aktuelle medicin bruger denne teknik til at bekæmpe sygdom.