Was ist ein Contig?

Ein Contig, kurz für zusammenhängende, bezieht sich entweder auf ein Desoxyribonukleinsäure -Segment (DNA) oder das Produkt überlappender Segmente, die eine kontinuierliche, umfangreiche, ununterbrochene DNA -Sequenz bilden.Durch die Untersuchung von Karten dieser Segmente ist es möglich, die Reihenfolge der Segmente zu ermitteln, die verschiedene Sequenzen umfassen, und Contigs können hinzugefügt, entfernt oder neu angeordnet werden, um neue Sequenzen zu bilden.DNA -Contig -Mapping und Bibliotheken ermöglichen es den Forschern, Ausrichtungen zu identifizieren, die Krankheiten verursachen, ein besseres Verständnis der Reaktion von Zellen unter bestimmten Bedingungen und die Fähigkeit ermöglichen, günstige Eigenschaften in lebenden Organismen zu klonen.Überlappung der passenden Sequenz -markierten Sets oder durch Matching Expressed Sequence -Tags.Durch das Verständnis dieses Bausteinprozesses, der von den Grundlagen der DNA -Segmente verwendet wird, können Contigs repliziert oder in wünschenswerte Sequenzen kloniert und weniger günstige Segmente hinzufügen oder beseitigen.Die Forscher betrachten diese Sequenzen als Karten zu hoch detaillierten, computergestützten DNA -Programmen.Das Programm bietet eine visuelle Aufschlüsselung der Basen, die zum Konstruktion der Segmente und der zum Erstellen bestimmten Sequenzen verwendet werden.Unter Verwendung verschiedener Farbschemata zeigen verschiedene CONIG -Programme diese Informationen als niedrige, mittelgroße und qualitativ hochwertige Sequenzen an.

CONGIG -Kartierung leuchtet häufig auf die Ursachen genetischer Störungen.Das Williams-Syndrom beispielsweise erzeugt bei Kindern, einschließlich kardiovaskulärer Probleme, einem erhöhten Blutkalziumspiegel und dem Gedeihen.Die Forscher entdeckten Banddeletionen, die bestimmte Gene beeinflussten, die durch unangemessene Überlappung von Contigs verursacht werden können.Eine andere genetische Kindheitsstörung, das CRI-DU-Chat-Syndrom, erzeugt auch mehrere Symptome, von denen jede glauben, dass sie mit Deletionen und abnormalen Positionierung korrelieren.

Forscher analysieren auch Contig -Sequenzen in Pflanzenarten.Jede Pflanze enthält eine Sequenzierung, die für diese Pflanze einzigartig ist, und durch die Erlangung von Karten einzelner Pflanzenarten entdecken Wissenschaftler ähnliche und unterschiedliche Eigenschaften, die zur Gesundheit oder Verschlechterung eines bestimmten Pflanzentyps beitragen können.Durch die Analyse von Contig -Segmenten und -Sequenzen in Krankheitsorganismen können Ärzte Merkmale bestimmen, die dann bei der Behandlung der Behandlungsentwicklung verwendet werden können.Die Zuordnung bietet visuelle Einblicke in mögliche genetische Manipulationen durch Sequenzdeletionen oder Klonen.

Wissenschaftler können klonierte DNA -Proben in bakteriellem künstlichem Chromosom, künstlichem Hefe -künstlichem Chromosom oder in P1- oder Phagen -künstlichen Chromosomenmedien anbauen.Diese Chromosomen enthalten 50 bis Hunderttausende von Basen, die Contig -Segmente zusammenstellen.Nach einer Kolonisationsperiode werden Proben unter Verwendung einer Spritze extrahiert und in DNA -Sequenzierungsgel platziert, die Elektrophorese und Trocknen unterzogen werden.Ein Autoradiograph liest die Probe und die Fingerabdrücke die Sequenzen.Forscher scannen dann den Fingerabdruck in eine Bilddatei, die später in ein CONIG -Programm geladen werden kann.