Qu'est-ce qu'un promoteur proximal?

Un promoteur proximal est une région de l'acide désoxyribonucléique (ADN) juste avant le début d'un gène où les protéines et autres molécules se lient à la préparation pour lire ce gène.La région du promoteur est essentielle pour que la plupart des gènes soient lus et transcrits en protéines, à la fois dans les cellules procaryotes simples et les eucaryotes plus complexes.Une variété de protéines appelées facteurs de transcription se lient à l'ADN dans cette région, et ils effectuent de nombreuses tâches se préparant à la transcription des gènes.La plus importante de ces fonctions est de construire un échafaudage de protéines qui maintient l'ADN ouvert et transcrit le gène approprié en même temps.

L'emplacement et la structure exactes d'un promoteur proximal varie entre les gènes et les types de cellules.Les cellules procaryotes, celles sans noyau, ont généralement un type de promoteur tandis que les cellules eucaryotes, celles avec un vrai noyau, en ont une autre.Les promoteurs se trouvent généralement quelques nucléotides en amont ou avant le gène qu'ils contrôlent.Presque chaque promoteur contient une séquence spéciale de nucléotides qui l'identifie comme telle.En général, les promoteurs procaryotes sont identifiés par un groupe de nucléotides appelés la séquence Shine-Dalgarno, et les promoteurs eucaryotes sont identifiés par une séquence génétique spécifique appelée Tata Box.

Malgré ces règles relativement simples, tous les promoteurs proximaux ne les suivent pas, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivent, qui les suivraientPeut les identifier et les gènes qu'ils contrôlent, quelque peu difficiles.La distance entre un promoteur et son gène n'est pas fixée au sein d'une espèce ou dans un seul organisme, donc déterminer où ils se trouvent les uns par rapport aux autres n'est pas trivial.Les compositions de séquence de promoteur proximale ne sont pas toujours identiques;Ils peuvent en longueur, en composition ou les deux.De plus, les séquences de marqueurs de la boîte Shine-Dalgarno ou de la boîte Tata ont une certaine variabilité en elles.La façon dont les facteurs de transcription variés reconnaissent les promoteurs face à cette variabilité inhérente n'est pas facile à déterminer, et de nouveaux exemples apparaissent fréquemment qui remettent en question ces solutions précédemment robustes.

Lorsqu'un gène est très proche d'un autre gène, la possibilité existe qui existe queSon promoteur proximal pourrait être affecté par l'action du gène voisin.Parfois, cela se fait délibérément dans le génome, peut-être pour stimuler plusieurs gènes à la fois ou réguler leur action simultanément.À d'autres moments, une connexion entre deux gènes à travers une activité de promoteurs se fait par erreur.Pour empêcher cette diaphonie entre les gènes où elle n'est pas justifiée, certains génomes ont des régions d'isolant entre eux.Cette région supplémentaire n'est pas toujours nécessaire, et certains génomes empêchent la diaphonie par le positionnement des gènes à d'autres égards, comme forcer un gène à être inactif tandis qu'un autre est actif.