Qu'est-ce que le profilage de l'expression des gènes?

Le profilage de l'expression des gènes est un moyen de mesurer les niveaux d'activité de milliers de gènes en même temps.L'identification des modèles d'expression des gènes dans un organisme est la prochaine étape après le séquençage du génome d'un organisme.Les expériences de profilage d'expression génique sont généralement effectuées sur tout le génome d'un organisme à la fois.Mesurer les niveaux d'expression des gènes dans un organisme fournit une image de la façon dont les cellules de l'organisme fonctionnent pendant le cycle cellulaire, ou en réponse à des stimuli spécifiques.

Les gènes d'un organisme peuvent être dans l'un des deux états: activé ou éteint.Lorsqu'un gène est allumé, il est transcrit en ARN messager, qui fournit les instructions pour fabriquer la protéine qui est codée par le gène.Lorsque les gènes sont activés, ils seraient exprimés.Lorsqu'un gène est éteint, il n'est pas transcrit dans l'ARNm et n'est pas exprimé.

L'ADN d'un organisme même à cellule ne contient des milliers de gènes, mais seule une fraction de ces gènes est activée à tout moment.Le schéma d'expression des gènes dans une cellule à un moment donné est appelé son profil de gène.Regarder les types de gènes activés dans une cellule peut fournir de grandes quantités d'informations importantes sur les cellules et les organismes.

Dans une expérience de profilage d'expression génique, la technologie des microréseaux d'ADN est utilisée pour obtenir une mesure de l'activité relative des gènes précédemment séquencés.Ces expériences impliquent généralement de mesurer des quantités d'ARNm dans un contexte de contrôle et dans un cadre expérimental, pour déterminer les effets d'une ou plusieurs variables sur l'expression des gènes.L'utilisation d'un contrôle est importante car elle établit des niveaux d'ARNm de base pour des conditions cellulaires normales.

En regardant comment les niveaux d'ARNm changent en réponse aux stimuli montrent comment les besoins cellulaires des protéines changent en réponse à de nouvelles conditions environnementales.Ces informations sont utiles à des fins de recherche pures, mais peuvent également être importantes en médecine.Par exemple, si les cellules cancéreuses du sein sont utilisées dans la microanalyse de l'ADN, un profil peut montrer que dans les cellules du sein cancéreuses, un certain type de récepteur est actif, ce qui est normalement inactif.Si le récepteur se révèle être spécifique au cancer, il peut s'avérer être une cible médicamenteuse efficace.

Le profilage de l'expression des gènes a en fait été utilisé comme mesure pronostique du cancer du sein.Ceci est utile car les femmes au même stade de la maladie peuvent répondre très différemment au traitement et ont des pronostics très différents.L'utilisation de la microanalyse de l'ADN pour développer les profils d'expression génique a montré dans au moins une étude qu'un certain profil d'expression génique dans les cellules cancéreuses du sein est en corrélation avec un mauvais pronostic.Cette application de la technologie de profilage d'expression génique aide à identifier les femmes qui peuvent bénéficier d'un traitement plus agressif.