En génétique, quelle est la méthode du fusil de chasse?

La méthode du fusil de chasse est utilisée pour séquencer les longs brins d'une molécule d'acide désoxyribonucléique (ADN).Il s'appuie sur une autre méthode de séquençage d'ADN appelé la méthode de terminaison de la chaîne.Avec la méthode du fusil de chasse, les scientifiques séquencent des parties du brin d'ADN et utilisent les résultats pour créer une séquence continue.

Le séquençage est le processus de recherche de la composition atomique d'une molécule et d'étude des liaisons chimiques qui unissent ces atomes.Dans l'ADN, le séquençage est utilisé pour trouver l'ordre dans lequel certaines molécules se produisent.Ces molécules sont appelées nucléotides.Les quatre bases nucléotidiques sont l'adénine, la guanine, la cytosine et la thymine.

Une façon de séquencer les longues brins d'ADN consiste à utiliser la méthode du fusil de chasse.Dans cette méthode, l'ADN est divisé en fragments aléatoires.Les segments résultants sont ensuite séquencés à l'aide d'une méthode appelée méthode de terminaison de la chaîne.La terminaison de la chaîne est la méthode de choix pour les séquences d'ADN courtes.Il utilise peu de produits chimiques durs et des quantités de radioactivité plus faibles que les autres méthodes de séquence courte.

Dans la méthode de terminaison de la chaîne, un brin d'ADN est divisé en quatre réactions de séquençage.Chacun contient les quatre nucléotides et une enzyme qui agit comme un catalyseur, appelé ADN polymérase.Un didésoxynucléotide, qui est essentiellement une partie nucléotidique manquante de sa séquence de sucre, est ensuite ajouté à chaque réaction de séquençage.Après avoir traité ces réactions, les scientifiques sont capables de les imaginer et de lire la séquence d'ADN.

Pendant la méthode de séquençage de l'ADN de fusil de chasse, tout cela se produit plusieurs fois en utilisant différents fragments aléatoires d'ADN.Il en résulte plusieurs sections de chevauchement d'ADN séquencées.Un programme informatique utilise ensuite les sections qui se chevauchent pour créer une séquence d'ADN continue.

Le problème avec la méthode du fusil de chasse est que l'ADN est incroyablement complexe.Souvent, il contient des séquences répétitives qui se ressemblent mais qui se produisent différentes parties de l'ADN.L'ensemble complet d'ADN humain, appelé le génome humain, a plus de trois milliards de paires de bases.La seule façon de s'assurer que le placement de séquences répétitives est correcte est de faire des lectures plus aléatoires afin que chaque pièce soit séquencée plusieurs fois.Même ainsi, des erreurs se produisent.

La méthode de séquençage du fusil de chasse était le bord de pointe du séquençage de l'ADN jusqu'en 2005. Depuis lors, les scientifiques ont créé le séquençage de nouvelle génération, ce qui fonctionne beaucoup plus rapidement.La précision des lectures individuelles est inférieure à celle du séquençage du fusil de chasse, mais les scientifiques sont compensés pour cela en pouvant faire plus de lectures en moins de temps.