Qu'est-ce qu'un contig?

Un contig, abrégé pour contigu, fait référence soit à un segment d'acide désoxyribonucléique (ADN), soit au produit de segments qui se chevauchent qui forment une séquence d'ADN continue, étendue et ininterrompue.En étudiant des cartes de ces segments, il est possible de découvrir l'ordre des segments comprenant diverses séquences, et des contigs peuvent être ajoutés, supprimés ou réorganisés pour former de nouvelles séquences.Le chevauchement des ensembles tagués de séquence correspondant ou en correspondant aux balises de séquence exprimées.En comprenant ce processus de bloc de construction utilisé par les bases des segments d'ADN, les contigs peuvent se reproduire ou se cloner en séquences souhaitables, ajoutant ou éliminant des segments moins favorables.Les chercheurs considèrent ces séquences comme des cartes sur des programmes d'ADN informatisés très détaillés.Le programme fournit une ventilation visuelle des bases utilisées pour construire les segments et les segments utilisés pour construire des séquences particulières.En utilisant différents schémas de couleurs, divers programmes Contig affichent ces informations comme des séquences faibles, moyennes et de haute qualité.

La cartographie des contigs met fréquemment la lumière sur les causes des troubles génétiques.Le syndrome de Williams, par exemple, produit des symptômes multi-systèmes chez les enfants, notamment des problèmes cardiovasculaires, des taux élevés de calcium sanguin et un défaut de prospération.Les chercheurs ont découvert les suppressions de bandes affectant certains gènes, qui peuvent être causés par un chevauchement inapproprié des contigs.Un autre trouble génétique de l'enfance, le syndrome de CRI-DU-BAT, produit également de multiples symptômes, dont chacun les scientifiques croient en corrélation avec les suppressions et le positionnement anormal.

Les chercheurs analysent également les séquences de contig dans les espèces végétales.Chaque plante contient un séquençage unique à cette plante, et en obtenant des cartes d'espèces de plantes individuelles, les scientifiques découvrent des caractéristiques similaires et variables qui peuvent contribuer à la santé ou à la détérioration d'un type de plante particulier.En analysant les segments de contig et les séquences dans les organismes portant des maladies, les médecins peuvent déterminer les traits qui peuvent ensuite être utilisés dans le développement du traitement.La cartographie fournit un aperçu visuel des manipulations génétiques possibles par des suppressions de séquence ou du clonage.

Les scientifiques peuvent cultiver des échantillons d'ADN clonés dans le chromosome artificiel bactérien, le chromosome artificiel de levure, ou dans des milieux de chromosomes artificiels artificiels de P1 ou du phage.Ces chromosomes contiennent de 50 à des centaines de milliers de bases, qui compilent des segments contig.Après une période de colonisation, les échantillons sont extraits à l'aide d'une seringue et placés dans un gel de séquençage d'ADN, qui subit une électrophorèse et des séches.Une autoradiographie lit l'échantillon et les empreintes digitales les séquences.Les chercheurs scannent ensuite l'empreinte digitale dans un fichier image, qui peut ensuite être chargé dans un programme contig.