Qu'est-ce qu'une base de données du génome?

Un génome est une collection de tout le matériel génétique présent dans un seul organisme.Comme la séquence et la structure de ce matériel génétique entraînent toute la vie biologique, les scientifiques sont très intéressés à découvrir à quoi ils servent tous.Une base de données du génome est une collection croisée d'informations sur un ou plusieurs organismes.d'information.Les bases de données informatisées sont donc le seul moyen pratique d'organiser les détails en un seul endroit.Généralement, ceux-ci sont disponibles en tant que bases de données en ligne pour la recherche scientifique.Un domaine de science relativement nouveau, appelé

bioinformatique,

a surgi pour perfectionner la façon dont les données biologiques peuvent être interprétées via des systèmes informatiques. Les bases de données des génomes contiennent la séquence des gènes d'un organisme si la séquence entière est connue.Sinon, il peut contenir des séquences partielles.Les génomes humains, souris et

Drosophila

Fly ont été séquencés, par exemple.Lorsque la séquence d'un génome est connue, les généticiens peuvent identifier des gènes particuliers dans le génome.Chaque gène est la feuille d'instructions pour un produit cellulaire particulier. Si un gène a une mutation, il a une séquence différente du gène fonctionnel normal.Les mutations peuvent être bénéfiques et produire une caractéristique utile de l'organisme muté.Ils peuvent également ne faire aucune différence pour le produit, ou ils peuvent être préjudiciables au fonctionnement normal de l'organisme.De nombreuses conditions médicales, par exemple, sont dues à des mutations dans un gène particulier.

Les mutations peuvent également être utilisées pour calculer à quel point une espèce particulière est étroitement liée à une autre, car de plus en plus de mutations s'accumulent au fil du temps.Les individus peuvent également varier dans la séquence du génome, d'autant plus que les grandes parties du génome ne sont pas des gènes et ne codent pas pour aucun produit cellulaire essentiel.Une base de données du génome contient une séquence d'un organisme désigné comme standard, mais il y aura de nombreuses différences mineures entre la norme arbitrairement choisie et les autres individus d'une espèce.

Malgré la présence de nombreuses différences, les gènes sont reconnaissables à travers des séquences.Si les généticiens savent ce que fait un gène particulier dans un organisme, alors un gène avec une séquence similaire chez un autre animal remplit probablement la même fonction.Les généticiens peuvent utiliser une base de données du génome soit pour identifier un gène qu'ils étudient, soit pour découvrir ce que fait le gène.

Chaque base de données du génome est consultable.Habituellement, les scientifiques peuvent rechercher une base de données de nombreuses manières différentes.Généralement, il peut saisir la séquence d'un gène qu'il a séquencé.Ensuite, la base de données trouve une ou plusieurs séquences similaires pour la comparaison.

Une manière plus simple de rechercher la base de données implique la recherche d'un mot de clé de gène, comme le nom du gène.Les autorités telles que la U.S.National Authority for Biotechnology Information (NCBI) peuvent donner aux séquences des numéros de référence distincts, et un généticien peut également rechercher une base de données du génome à l'aide de l'un de ces identifiants.Il peut également réduire les résultats en utilisant plus de paramètres de recherche.Les informations référencées sont une caractéristique de la plupart des bases de données du génome, et un résultat de séquence unique fournira également à l'utilisateur de la base de données avec des liens utiles pour plus d'informations génétiques.En plus des informations sur une séquence spécifique, de nombreuses bases de données fournissent une représentation visuelle de la séquence et des caractéristiques notables de ce domaine.

Différents organismes peuvent avoir des bases de données de génome spécifiques, mais certaines bases de données plus grandes contiennent plus d'une espèce.Diverses autorités contrôlent les différentes bases de données disponibles, de sorte que les bases de données peuvent toutes utiliser des formats et des capacités de recherche distincts.Certains exemples de ces autorités incluent le NCBI, l'Institut européen de bioinformatique ou même les universités individuelles.