Qu'est-ce que l'annotation du génome?

L'annotation du génome marque les sections d'un génome avec des informations sur les données génétiques qu'il contient.Cela fait partie du processus dans les projets du génome, où l'objectif n'est pas seulement de séquencer l'ADN d'un organisme cible, mais de comprendre ce qu'il fait et comment il fonctionne.Les chercheurs peuvent effectuer une annotation dans leurs laboratoires et partager des données avec d'autres scientifiques pour mettre en commun les ressources et les informations.Les bases de données en ligne ouvertes au public sont disponibles, et certains permettent également aux membres du grand public de soumettre leurs propres annotations.

La première étape de l'annotation du génome est le séquençage, où les chercheurs déterminent l'ordre des acides aminés dans l'ADN des organismes.Le séquençage d'un génome entier prend beaucoup de temps, et il est courant que les scientifiques commencent l'anotation avant que le génome ne soit décodé.Avec une section d'ADN séquencée en main, un chercheur peut commencer l'anotation.Les scientifiques peuvent noter où les gènes semblent commencer et s'arrêter, faisant attention à des chaînes distinctives d'ADN qui contiennent des informations sur la fonction du génome.

Les ordinateurs sont capables d'effectuer une annotation du génome par eux-mêmes.Ils peuvent rechercher des modèles connus, tels que des chaînes d'acides aminés qui apparaissent au début et à la fin des gènes.En annotation automatisée, l'ordinateur peut ajouter des notes à différentes sections d'une chaîne d'ADN pour fournir des informations à ce sujet.Il est également possible de comparer les segments de différents organismes pour rechercher la variance qui pourrait fournir des informations importantes sur l'espèce dans son ensemble.

L'annotation manuelle du génome implique l'examen physique de l'ADN.De nombreux chercheurs utilisent des ordinateurs pour afficher les informations et les marquer, leur permettant de les saisir dans des bases de données pendant qu'ils fonctionnent.Dans certains cas, un examen manuel peut être nécessaire après l'annotation automatisée, pour s'assurer que l'ordinateur a correctement correct les informations.Cela peut être un processus minutieux et des erreurs se produisent, ce qui est l'une des raisons pour lesquelles les chercheurs aiment mettre en commun des bases de données.Si une annotation ne correspond pas aux autres sur la même section d'ADN, les gens peuvent évaluer les informations pour déterminer ce qui s'est passé et fixer l'erreur.

Il n'est pas toujours possible de déterminer ce qu'un gène fait pendant le processus d'annotation du génome.Les scientifiques peuvent signaler les gènes et les séparer des autres composants du génome, comme les répétitions de l'ADN non codant.Ces informations peuvent être utilisées dans la recherche car les gens développent des théories sur différents segments du génome.Ils peuvent ajouter aux annotations pour noter la fonction d'un gène.