Cos'è un promotore prossimale?

Un promotore prossimale è una regione nell'acido desossiribonucleico (DNA) appena prima dell'inizio di un gene in cui proteine e altre molecole si legano in preparazione alla lettura di quel gene.La regione del promotore è essenziale affinché la maggior parte dei geni venga lettura e trascritta in proteina, sia nelle semplici cellule procariotiche che negli eucarioti più complessi.Una varietà di proteine chiamate fattori di trascrizione si legano al DNA in questa regione e svolgono molte attività che si preparano per la trascrizione genica.Il più importante di queste funzioni è la costruzione di un'impalcatura di proteine che tiene aperto il DNA e trascrive il gene adeguato allo stesso tempo.

La posizione esatta e la struttura di un promotore prossimale varia tra geni e tipi di cellule.Le cellule procariotiche, quelle senza nucleo, di solito hanno un tipo di promotore mentre le cellule eucariotiche, quelle con un vero nucleo, ne hanno un altro.I promotori di solito giacciono alcuni nucleotidi a monte o prima, del gene che controllano.Quasi ogni promotore contiene una sequenza speciale di nucleotidi che lo identifica come tale.In generale, i promotori procariotici sono identificati da un gruppo di nucleotidi chiamato sequenza Shine-Dalgarno e i promotori eucariotici sono identificati da una specifica sequenza genetica chiamata Tata Box.

Nonostante queste regole relativamente semplici, non tutti i promotori prossimali ne seguono, che li seguonopuò farli identificare e i geni che controllano, un po 'difficili.La distanza tra un promotore e il suo gene non è fissata all'interno di una specie o all'interno di un singolo organismo, quindi determinare dove si siedono l'uno rispetto all'altro non è banale.Le composizioni di sequenza promotore prossimale non sono sempre identiche;Possono molto in lunghezza, composizione o entrambi.Inoltre, le sequenze di marker della scatola Shine-Dalgarno o Tata Box hanno una certa variabilità.In che modo i vari fattori di trascrizione riconoscono i promotori di fronte a questa intrinseca variabilità non è facile da determinare e nuovi esempi appaiono frequentemente che mettono in discussione queste soluzioni precedentemente robuste.

Quando un gene è molto vicino a un altro gene, esiste la possibilitàIl suo promotore prossimale potrebbe essere influenzato dall'azione del gene vicino.A volte, questo viene fatto di proposito nel genoma, forse per stimolare più geni contemporaneamente o regolare la loro azione contemporaneamente.Altre volte, una connessione tra due geni attraverso un'attività dei promotori viene eseguita per errore.Per prevenire questo talk incrociato tra i geni in cui non è garantito, alcuni genomi hanno regioni isolante tra di loro.Questa regione extra non è sempre necessaria e alcuni genomi impediscono il cross-talk mediante il posizionamento del gene in altri modi, come costringere un gene ad essere inattivo mentre un altro è attivo.