Cos'è l'analisi di microarray?
L'analisi del microarray del DNA viene utilizzata nella biologia molecolare e nella medicina diagnostica per determinare quali geni in una cellula sono attivati in un certo momento.Questa tecnica è nota come test multiplex, perché può misurare migliaia di campioni in un singolo test.Le tecniche di microanalisi del DNA vengono utilizzate per interpretare i dati dai saggi effettuati sull'RNA e sul DNA, a seconda dei requisiti particolari dell'esperimento.
La base dell'analisi del microarray del DNA è l'elevata specificità delle molecole di DNA e la capacità di scegliere unicheSequenze di DNA per rappresentare un particolare gene.Un esperimento di analisi di microarray viene condotto su una superficie solida realizzata con un chip di vetro o silicone su cui è gettata una matrice chimica.Sulla superficie delle sonde DNA o RNA della matrice sono allineate in file ordinate.
Una volta che il chip è stato impostato con le sonde richieste, vengono preparate le celle da studiare.Per preparare le cellule, devono essere aperti in modo che gli acidi nucleici che contengono possano essere isolati.Una serie di reagenti viene aggiunta per estrarre e concentrare gli acidi nucleici contenuti all'interno delle cellule.Successivamente, l'estratto di acido nucleico viene aggiunto al chip, che viene quindi lasciato per diverse ore per consentire alle sonde di interagire e legarsi agli acidi nucleici cellulari.Infine, un'ulteriore serie di reagenti viene aggiunta al chip per identificare le posizioni in cui gli acidi nucleici cellulari sono legati alle sonde. L'analisi del microarray
viene quindi utilizzata per determinare quali sonde sono state in grado di rilevare acidi nucleici cellulari.Questa è spesso un'analisi complessa, poiché un singolo chip può contenere decine di migliaia di sonde uniche.L'ordine delle sonde sul chip è memorizzato in un database di computer in modo che i risultati possano essere ottenuti facilmente.Utilizzando il chip e il database, uno scienziato può sviluppare un elenco di geni che hanno legato alle sonde ed erano quindi presenti nell'estratto cellulare originale.
La tecnica di analisi del microarray è comunemente usata nella profilazione dell'espressione genica.In questo tipo di esperimento, il microarray è impostato per esaminare i modelli di espressione genica nelle cellule.Le sonde per i geni di interesse sono incluse nel microarray e quando l'esperimento è completo, l'analisi dei dati di microarray può determinare quale dei geni studiati sono stati attivati in un determinato momento.
Altri usi per questa tecnica includono l'ibridazione genomica comparativa e il rilevamento di SNP.L'ibridazione genomica comparativa è un test che esamina il contenuto genomico nelle cellule di organismi correlati.Questo tipo di dosaggio fornisce informazioni sulle relazioni genetiche tra diverse specie. Il rilevamento di SNP è una tecnica che può essere utilizzata nell'analisi forense, nell'analisi del legame genetico e nella valutazione dei rischi di malattie genetiche.I SNP sono polimorfismi a singolo nucleotide, posizioni sul genoma in cui vi sono due possibili sequenze di coppie di base.Gli SNP possono fornire una serie di utili informazioni genetiche a causa del fatto che esistono diverse variazioni SNP in diverse popolazioni etniche e geografiche.