Cos'è la grafica molecolare?
Il termine grafica si riferisce a disegni o immagini create seguendo le regole della matematica. Molecolare si riferisce alle molecole e ai loro componenti.Pertanto, un significato della grafica molecolare (mg) è lo studio delle molecole attraverso la visualizzazione delle molecole stesse e le loro parti componenti.La grafica molecolare si riferisce anche alle rappresentazioni tridimensionali delle molecole che vengono fatte per esaminarle e comprendere le loro risposte durante le reazioni e le interazioni
La grafica molecolare presenta alcuni vantaggi rispetto ai modelli fisici.I modelli fisici possono causare problemi perché la struttura è oscurata, c'è una falsa impressione di flessibilità, la sovrapposizione è quasi impossibile o sono semplicemente troppo ingombranti con cui lavorare.Tutti questi problemi possono essere superati con la grafica computer. Un uso chiave della grafica molecolare è nello studio di proteine e acidi nucleici.Il collaboratore di ricerca per la bioinformatica strutturale (RCSB) Protein Data Bank (PDB), in cui vengono conservate informazioni determinate sperimentalmente sulle strutture di acidi nucleici, proteine e gruppi complessi.A partire dal 27 aprile 2010, c'erano 64.932 strutture nel database.L'RCSB divulga la loro funzione con un invito ai visitatori a costruire modelli di virus 3D all'Università di Rutgers il Giorno di Rutgers.L'RCSB sponsorizza anche le prove di modellazione proteica presso le Olimpia scientifiche regionali negli Stati Uniti.La Worldwide Protein Data Bank (WWPDB) è l'organizzazione internazionale a cui gruppi come RCSB;PDBE, la controparte europea;e PDBJ, la controparte giapponese;appartenere.Un'altra area in cui la grafica molecolare è estremamente importante è la progettazione di prodotti farmaceutici.Molecular-Graphics Assisted Drug Design Mdash;Conosciuto anche come progettazione di farmaci assistiti da computer (CADD), design molecolare assistito da computer (CAMD) o progettazione di farmaci a base di struttura (SBDD) e mdash;è uno dei principali interessi di ricerca della facoltà coinvolti nella specializzazione della chimica medicinale della Virginia Commonwealth University nei programmi di laurea in scienze farmaceutiche, per esempio. Software specializzato per creare grafica molecolare, chiamato
software di progettazione molecolare , è disponibile in una serie di pacchetti commerciali.Esistono anche versioni particolari dedicate alla progettazione di farmaci basata su grafici molecolari.Nella progettazione di farmaci, la caratteristica di docking
La capacità di collegare una molecola visualizzata a un recettore - è uno degli attributi chiave che hanno distinto il software di progettazione di farmaci forma altri software di progettazione molecolare.