Cos'è l'annotazione del genoma?

Sezioni di annotazione del genoma di un genoma con informazioni sui dati genetici che contiene.Questo fa parte del processo di Genome Projects, in cui l'obiettivo non è solo quello di sequenziare il DNA di un organismo target, ma di capire cosa fa e come funziona.I ricercatori possono condurre annotazioni nei loro laboratori e possono condividere dati con altri scienziati per raggruppare risorse e informazioni.Sono disponibili database online aperti al pubblico e alcuni consentono anche ai membri del pubblico di presentare le proprie annotazioni.

Il primo passo nell'annotazione del genoma è il sequenziamento, in cui i ricercatori determinano l'ordine degli aminoacidi in un DNA di organismi.Il sequenziamento di un intero genoma richiede molto tempo ed è comune per gli scienziati iniziare a annotare prima che il genoma sia stato decodificato.Con una sezione di DNA sequenziato in mano, un ricercatore può iniziare a annotare.Gli scienziati possono notare dove i geni sembrano iniziare e fermarsi, prestando attenzione alle stringhe distintive del DNA che contengono informazioni sulla funzione del genoma. I computer sono in grado di eseguire un po 'di annotazione del genoma da soli.Possono cercare modelli noti, come stringhe di aminoacidi che appaiono all'inizio e alla fine dei geni.Nell'annotazione automatizzata, il computer può aggiungere note a diverse sezioni di una stringa di DNA per fornire informazioni al riguardo.È anche possibile confrontare segmenti di diversi organismi per cercare varianza che potrebbe fornire informazioni importanti sulla specie nel suo insieme. L'annotazione del genoma manuale

comporta la revisione fisica del DNA.Molti ricercatori usano i computer per visualizzare le informazioni e taggarle, consentendo loro di inserirle in database mentre funzionano.In alcuni casi, potrebbe essere necessaria una revisione manuale dopo l'annotazione automatizzata, per assicurarsi che il computer abbia ottenuto le informazioni corrette.Questo può essere un processo scrupoloso e si verificano errori, che è uno dei motivi per cui ai ricercatori amano raggruppare i database.Se un'annotazione non corrisponde agli altri nella stessa sezione del DNA, le persone possono valutare le informazioni per determinare cosa è successo e correggere l'errore.

Non è sempre possibile determinare cosa fa un gene durante il processo di annotazione del genoma.Gli scienziati possono contrassegnare i geni e separarli da altri componenti del genoma, come il DNA non codificante come ripetizioni.Queste informazioni possono essere utilizzate nella ricerca mentre le persone sviluppano teorie su diversi segmenti del genoma.Possono aggiungere alle annotazioni per notare la funzione di un gene.