Wat is een contig?

Een contig, kort voor aaneengesloten, verwijst naar een deoxyribonucleïnezuur (DNA) segment of het product van overlappende segmenten die een continue, uitgebreide, ononderbroken DNA -sequentie vormen.Door kaarten van deze segmenten te bestuderen, is het mogelijk om de volgorde van segmenten te ontdekken die verschillende sequenties omvatten, en contigs kunnen worden toegevoegd, verwijderd of herschikt om nieuwe sequenties te vormen.Mapping en bibliotheken van DNA contig stellen onderzoekers in staat om afstemming te identificeren die ziekten kunnen veroorzaken, een beter inzicht geven in hoe cellen onder bepaalde omstandigheden reageren en het vermogen mogelijk maken om gunstige kenmerken in levende organismen te klonen.

Genomische contigs zijn verbonden met een andere door de andere door de andereOverlapping van bijpassende sequentie -tagged sets of door matching expressed sequence -tags.Door dit bouwsteenproces te begrijpen dat wordt gebruikt door de bases van DNA -segmenten, kunnen contigs worden gerepliceerd of gekloneerd in gewenste sequenties, waardoor minder gunstige segmenten worden toegevoegd of geëlimineerd.Onderzoekers beschouwen deze sequenties als kaarten op zeer gedetailleerde, geautomatiseerde DNA -programma's.Het programma biedt een visuele uitsplitsing van de basen die worden gebruikt om de segmenten te construeren, en de segmenten die worden gebruikt om bepaalde sequenties te bouwen.Met behulp van verschillende kleurenschema's geven verschillende contig -programma's deze informatie weer als lage, gemiddelde en hoogwaardige sequenties.

Contig mapping werpt vaak licht op de oorzaken van genetische aandoeningen.Williams-syndroom produceert bijvoorbeeld multi-systeemsymptomen bij kinderen, waaronder cardiovasculaire problemen, verhoogde calciumspiegels van het bloed en het falen om te gedijen.Onderzoekers ontdekten banddeleties die bepaalde genen beïnvloeden, die kunnen worden veroorzaakt door ongepaste overlapping van contigs.Een andere genetische kinderstoornis, CRI-Du-Chat-syndroom, produceert ook meerdere symptomen, die elk van wetenschappers geloven dat correleren met deleties en abnormale positionering.

Onderzoekers analyseren ook contigsequenties bij plantensoorten.Elke plant bevat sequencing die uniek is voor die plant, en door het verkrijgen van kaarten van individuele plantensoorten, ontdekken wetenschappers vergelijkbare en variërende kenmerken die kunnen bijdragen aan de gezondheid of verslechtering van een bepaald plantentype.Door het analyseren van contig -segmenten en sequenties bij ziektebestrijdingsorganismen, kunnen artsen eigenschappen bepalen die vervolgens kunnen worden gebruikt bij de ontwikkeling van de behandeling.Mapping biedt visueel inzicht in mogelijke genetische manipulaties door sequentiedeleties of klonen.

Wetenschappers kunnen gekloonde DNA -monsters laten groeien in bacterieel kunstmatig chromosoom, kunstmatige chromosoom van gist of in P1 of faag kunstmatige chromosoommedia.Deze chromosomen bevatten overal van 50 tot honderdduizenden bases, die contig -segmenten samenstellen.Na een periode van kolonisatie worden monsters geëxtraheerd met behulp van een spuit en geplaatst in DNA -sequencing -gel, die elektroforese en droog ondergaat.Een autoradiograaf leest het monster en vingerafdrukken de sequenties.Onderzoekers scannen vervolgens de vingerafdruk in een afbeeldingsbestand, dat later in een contig -programma kan worden geladen.