Wat is een microsatelliet?
Een microsatelliet is een korte, repetitieve sequentie van DNA.Omdat ze de neiging hebben om weinig te variëren tussen nauw verwante organismen, worden microsatellieten vaak door wetenschappers gebruikt als genetische markers om individuen te identificeren die uit dezelfde fokpopulatie komen.Ze staan ook bekend als korte tandemherhalingen (STR's) en eenvoudige sequentieverhalingen (SSR's).
Als men denkt aan een molecuul DNA als op een ladder lijkt, dan bestaat elke spier in de ladder uit een paar kleinere moleculen genoemdnucleotiden.De vier nucleotiden die in DNA verschijnen, zijn adenine (A), guanine (G), thymine (T) en cytosine (C).Adenineparen met thymine en guanineparen met cytosine.De volgorde waarin deze base -paren verschijnen, geeft een streng DNA zijn unieke handtekening en vormt een code die genetische informatie opslaat.
Een microsatelliet treedt op wanneer een korte reeks basenparen, meestal tussen 1 en 6, meerdere keren herhaalteen rij.Het volgende diagram van een korte streng DNA toont een enkel microsatelliet dat bestaat uit de eenheid GTC op de bovenste helft en cag op de onderste helft, elk 4 keer herhaald.Wetenschappers zouden dit vertegenwoordigen als (GTC) 4 of (CAG) 4 :
G T C G T C G T C G T C ||||||||||||C a g c a g c a g c a g
Deze groepen herhalende sequenties werden microsatellieten genoemd omdat, wanneer DNA wordt gescheiden door het in een centrifuge te draaien, het de neiging heeft om te groeperen in een grote hoofdband omringd door kleinere, satellietbanden.Onderzoekers noemden het DNA dat ze in deze bands vonden, minisatellieten en microsatellieten.Minisatellieten zijn langere segmenten, die kunnen bestaan uit maximaal ongeveer 100 herhalende basenparen.
Microsatellietmarkers zijn vaak nuttig voor het identificeren van individuen uit dezelfde fokpopulatie.Zelden treden mutaties op wanneer een genetische sequentie wordt doorgegeven van een ouder naar kind, wat resulteert in meer of minder eenheden van het herhalende segment.Dus in ons voorbeeld hierboven zou (CAG) 4 kunnen worden (CAG) 3 of (CAG) 5
.Deze mutaties komen vaak voldoende voor dat een wilde fokpopulatie waarschijnlijk verschillende microsatellieten heeft dan andere fokgroepen, maar ze komen niet vaak genoeg voor dat individuen binnen een enkele fokgroep waarschijnlijk bepaalde karakteristieke sequenties delen. De meeste microsatellieten worden gevonden in nietCodering DNA mdash;DNA dat niet de code of instructies heeft om eiwitten te produceren.Bijgevolg wordt er niet aangenomen dat ze een belangrijke rol spelen bij het functioneren van celfuncties.Er is echter reden om te geloven dat een microsatelliet normale celprocessen kan verstoren als deze te groot wordt.In het geval van de ziekte van Huntingtons kan het aantal herhalingen van een bepaalde sequentie bijvoorbeeld het verschil betekenen tussen het beïnvloeden door de ziekte of een niet-getroffen drager zijn.