Wat is een transcriptoom?

Het transcriptoom is een volledige verzameling RNA uit een organisme, een groep cellen of zelfs een specifieke cel.RNA wordt gesynthetiseerd uit DNA door een proces dat bekend staat als transcriptie.Het RNA aanwezig in een cel en het lichaam bepaalt welke genen tot expressie worden gebracht, en het verandert in de loop van het leven van een organismen, in tegenstelling tot DNA, dat statisch blijft.Omgevingsdruk is een van de leidende redenen voor veranderingen, omdat het lichaam probeert zich aan te passen aan veranderende omgevingssituaties om zichzelf te laten functioneren.

Het transcriptoom is veel kleiner dan een organismengenoom, de volledige verzameling DNA in het organisme.In eenvoudige bewoordingen geplaatst, zou men DNA als een kookboek kunnen beschouwen, met een complete verzameling recepten die kunnen worden gemaakt.Het transcriptoom is de code die bepaalt welke recepten zullen worden gemaakt en wanneer.Het kookboek blijft statisch gedurende het leven, terwijl de transcriptoom verandert in reactie op omgevingsfactoren.

Een belangrijk onderdeel van het transcriptoom is mRNA -moleculen.Messenger RNA is RNA dat communiceert met de ribosomen in de cellen om de cellen te sturen om verschillende eiwitten te maken.Deze eiwitten worden gebruikt voor een breed scala aan functies.Andere delen mogen niet direct coderen voor eiwitproductie, maar dingen doen zoals het bepalen van de celstructuur en het reguleren van genexpressie.Samen houden de verschillende componenten van het transcriptoom een organisme te laten functioneren en bepalen genexpressie binnen dat organisme.

Binnen verschillende cellen in het lichaam kan het transcriptoom heel verschillend zijn.Levercellen hebben bijvoorbeeld RNA waardoor ze levercellen zijn en ervoor zorgen dat de cellen de nodige functies uitvoeren.Huidcellen daarentegen hebben een ander transcriptoom dat de genen activeert die nodig zijn om van een cel een huidcel te maken.Zowel lever- als huidcellen hebben een complete kopie van het genoom, maar hun transcriptomen bepalen welke delen van het genoom zijn geactiveerd.

Net als bij DNA is het mogelijk om RNA te sequentie.Transcriptoomsequencing kan worden gedaan om meer te weten te komen over de acties van een cel en de gastheerorganismen DNA, en om de plaatsen te identificeren waar de expressie van genetische informatie misgaat.Wanneer een levercel bijvoorbeeld kwaadaardig wordt, is het omdat het transcriptoom niet werkt zoals het zou moeten zijn en genen voor maligniteit zijn geactiveerd, of de cellen missen regulatie op een of andere manier, waardoor ze uit de controle groeien.Sequencing Het RNA in een kwaadaardige cel kan een onderzoeker helpen erachter te komen welk gen is geactiveerd of geïnactiveerd om de maligniteit te veroorzaken.