Wat is een zinkvinger?

Een zinkvinger is een vingervormige eiwitvouw die wordt gevormd door specifieke aminozuren in de eiwitbinding aan een zinkion.Deze eiwitten binden vaak aan DNA en RNA omdat hun vorm nauwe interactie van het domein mogelijk maakt met de nucleotiden van DNA en RNA.Hun nucleotide -bindende eigenschappen stellen hen in staat om te functioneren bij het reguleren van genexpressie en in virusassemblage.

Er zijn verschillende soorten zinkvingerstructuren, maar de meest voorkomende versie bestaat uit een alfa -helix en een bètablad, de twee meest voorkomende secundaire structuren in eiwitten, aan weerszijden van ten minste één zinkion.Het alpha -helix en het bètablad worden in positie gehouden door cystine- en histidine -residuen, die het zinkion coördineren via hun stikstof- en zwavelatomen.De zinkvinger bindt aan DNA en door de interactie van aminozuren aan de periferie met basenparen in het midden van de DNA -dubbele helix.Het is een compact eiwitdomein en het kleine formaat zorgt ervoor dat het de nabijheid van DNA -basenparen kan hebben.

Deze eiwitten zijn de meest voorkomende transcriptiefactoren in levende organismen.Een transcriptiefactor is een eiwit dat bindt aan DNA en de overdracht van genetische informatie naar RNA regelt.Het feit dat deze eiwitten om DNA te richten, heeft hen kandidaten gemaakt voor doelgerichte re-engineering om DNA-sequenties van interesse te richten.

Bijvoorbeeld, een zinkvingernuclease (ZFN) is een synthetisch eiwit dat een ontworpen zinkvingerbindend domein heeft gefuseerd tot een restrictie-endonuclease of DNA-splitsend enzym.De ZFN kan worden gebruikt om DNA op specifieke locaties te snijden en is een nuttig hulpmiddel om locatiespecifieke recombinatie van DNA te bevorderen.Gemanipuleerde zinkvingers kunnen ook worden gebruikt als kunstmatige transcriptiefactoren.

Zinkvingerdomeinen worden gevonden in sommige virale eiwitten, waaronder het neocapside (NC) -eiwit van het menselijke immunodeficiëntie-1 (HIV-1) virus.NC is een aantrekkelijk antiviraal doelwit omdat het belangrijk is voor virale assemblage en sterk geconserveerd is.Remmers die specifiek gericht zijn op de zinkvingers van virale en retrovirale eiwitten kunnen worden gebruikt om virusreplicatie te voorkomen.Het verkrijgen van antivirale verbindingen van deze aard is een actief gebied van biomedisch onderzoek.

Deze eiwitten spelen een belangrijke rol in het normale metabolisme van cellen.Om effectief te zijn, moeten anti-retrovirale verbindingen zich specifiek richten op retrovirale zinkvingereiwitten.Deze retrovirale eiwitten hebben verschillende aminozuursequenties en structurele verschillen met cellulaire zinkvingeriwitten, dus het verkrijgen van selectieve remmers is een haalbaar doel.