Hva er en proksimal promoter?

En proksimal promoter er en region i deoksyribonukleinsyre (DNA) like før begynnelsen av et gen der proteiner og andre molekyler binder seg i preparat for å lese det genet.Promoter -regionen er essensielt for at de fleste gener blir lest og transkribert til protein, i både enkle prokaryote celler og de mer komplekse eukaryotene.En rekke proteiner som kalles transkripsjonsfaktorer binder seg til DNA i denne regionen, og de utfører mange oppgaver som forbereder seg på gentranskripsjon.Det viktigste av disse funksjonene er å bygge et stillas av proteiner som holder DNA åpent og transkriberer riktig gen samtidig.

Den nøyaktige plasseringen og strukturen til en proksimal promoter varierer mellom gener og celletyper.Prokaryote celler, de uten kjerner, har vanligvis en type promoter mens eukaryote celler, de med en ekte kjerne, har en annen.Promotorer ligger vanligvis noen få nukleotider oppstrøms, eller før, genet de kontrollerer.Nesten hver promotør inneholder en spesiell sekvens av nukleotider som identifiserer den som sådan.Generelt identifiseres prokaryote promotorer av en gruppe nukleotider kalt Shine-Dalgarno-sekvensen, og eukaryote promotorer identifiseres ved en spesifikk genetisk sekvens som kalles Tata-boksen.

til tross for disse relativt enkle reglene, ikke alle proksimale promoter følger dem, som?kan gjøre å identifisere dem, og genene de kontrollerer, noe vanskelige.Avstanden mellom en promoter og genet er ikke festet innenfor en art eller i en enkelt organisme, så det er ikke trivielt å bestemme hvor de sitter i forhold til hverandre.Proksimale promotersekvenssammensetninger er ikke alltid identiske;De kan veldig i lengde, sammensetning eller begge deler.I tillegg har markørsekvensene til Shine-Dalgarno-boksen eller Tata-boksen en viss variasjon i seg.Hvordan de varierte transkripsjonsfaktorene gjenkjenner promotorer i møte med denne iboende variabiliteten er ikke lett å bestemme, og nye eksempler vises ofte som spørsmål om disse tidligere robuste løsningene.

Når et gen er veldig nær et annet gen, eksisterer muligheten somDen proksimale promotoren kan bli påvirket av virkningen av det nærliggende genet.Noen ganger gjøres dette med vilje i genomet, kanskje for å stimulere flere gener samtidig eller regulere deres handling samtidig.Andre ganger blir en forbindelse mellom to gener gjennom en promotorsaktivitet gjort i feil.For å forhindre denne krysspraten mellom gener der det ikke er berettiget, har noen genom isolatorregioner mellom seg.Denne ekstra regionen er ikke alltid nødvendig, og noen genomer forhindrer kryssprat ved genposisjonering på andre måter, som å tvinge ett gen til å være inaktivt mens et annet er aktivt.