Hva er mikroarray -analyse?

DNA -mikroarray -analyse brukes i molekylærbiologi og diagnostisk medisin for å bestemme hvilke gener i en celle som er slått på på et bestemt tidspunkt.Denne teknikken er kjent som en multiplex -analyse, fordi den kan måle tusenvis av prøver i en enkelt analyse.DNA -mikroanalyseteknikker brukes til å tolke data fra analyser utført på RNA så vel som DNA, avhengig av de spesielle kravene til eksperimentet.

Grunnlaget for DNA -mikroarray -analyse er den høye spesifisiteten til DNA -molekyler, og evnen til å velge unikSekvenser av DNA for å representere et bestemt gen.Et mikroarray -analyseeksperiment utføres på en fast overflate laget av en glass eller silikonbrikke som er lagt en kjemisk matrise.På overflaten av matrisen er DNA- eller RNA -sonder stilt opp i ordnede rader.

Når brikken er satt opp med de nødvendige sonder, blir cellene som studeres utarbeidet.For å fremstille cellene, må de brytes åpne slik at nukleinsyrene de inneholder kan isoleres.En serie reagenser tilsettes for å trekke ut og konsentrere nukleinsyrene som finnes i cellene.Deretter tilsettes nukleinsyreekstraktet til brikken, som deretter blir igjen i flere timer for å gi tid til at sonderne kan samhandle og binde seg til de cellulære nukleinsyrene.Til slutt blir en ytterligere serie reagenser tilsatt til brikken for å identifisere steder der cellulære nukleinsyrer har bundet seg til sonder.

mikroarray -analyse blir deretter brukt til å bestemme hvilke sonder som har vært i stand til å oppdage cellulære nukleinsyrer.Dette er ofte en kompleks analyse, ettersom en enkelt brikke kan inneholde titusenvis av unike sonder.Rekkefølgen på sonder på brikken lagres i en database slik at resultatene enkelt kan oppnås.Ved hjelp av brikken og databasen kan en forsker utvikle en liste over gener som har bundet til sonder og derfor var til stede i det originale cellulære ekstraktet.

Mikroarray -analyseteknikken brukes ofte i genuttrykksprofilering.I denne typen eksperiment er mikroarray satt opp for å undersøke mønstre av genuttrykk i celler.Prober for genene av interesse er inkludert på mikroarrayen, og når eksperimentet er fullført, kan mikroarray -dataanalyse bestemme hvilken av genene som ble studert som ble slått på på et bestemt tidspunkt.

Andre bruksområder for denne teknikken inkluderer sammenlignende genomisk hybridisering og SNP -deteksjon.Sammenlignende genomisk hybridisering er en test som undersøker genomisk innhold i celler av relaterte organismer.Denne typen analyser gir informasjon om de genetiske sammenhengene mellom forskjellige arter.

SNP -deteksjon er en teknikk som kan brukes i rettsmedisinske analyser, genetisk koblingsanalyse og vurdering av genetisk sykdomsrisiko.SNP er enkeltnukleotid-polymorfismer, steder på genomet der det er to mulige basepar-sekvenser.SNP kan gi en rekke nyttig genetisk informasjon på grunn av det faktum at forskjellige SNP -variasjoner eksisterer i forskjellige etniske og geografiske populasjoner.