I biologi, hva er en konsensus -sekvens?

En konsensus -sekvens er et sett med proteiner, eller nukleotider i deoksyribonukleinsyre (DNA), som vises regelmessig.Aminosyrene adenin, guanin, cytosin og tymin utgjør genetiske sekvenser i DNA.Molekylære biologer bruker ofte statistikk for å forutsi hvor en viss sekvens av dem vil være, eller for å forstå hvor bestemte molekyler har en tendens til å binde seg.Hvor aminosyresekvensene forblir de samme og hvor de har en tendens til å variere, kan bli representert med en formel.Når det gjelder en konsensuspromotersekvens, kan en bestemt type enzym binde seg til steder med lignende sekvenserte proteiner.

Genetikere, som forskere i mange vitenskapelige disipliner, bruker ofte substitusjoner for å forenkle komplekse systemer.Det er så mange aminosyrebaser og gener i kroppen at forskere ikke kan telle dem med mindre det er noe generelt system for å gjøre det.En konsensus -sekvens kan også vises mange steder i DNA i forskjellige levende ting.Likhetene og forskjellene som har en tendens til å oppstå, kan indikeres med en formel.

Statistisk sett kan forskere klassifisere genetiske sekvenser for å se etter mønstre.Gjenta mønstre, kalt sekvensmotiver, brukes vanligvis til å representere genetiske områder som kontrollerer spesifikke biologiske prosesser.Konsensus -sekvenser kan også gi innsikt i hvordan proteiner syntetiseres eller hvordan molekyler blir guidet i en celle.

I notasjonen av en konsensus -sekvens kan plasseringen av noen nukleotider vise at de alltid er på det representerte stedet.Det kan også indikeres at ett nukleotid eller et annet kan være der.I dette tilfellet er hvor ofte en aminosyre vises, i stedet for en annen, generelt ikke oppgitt.En grafisk modell brukes noen ganger for å indikere denne frekvensen, ved å øke eller redusere størrelsen på symbolene.Noen programmer kan generere sekvenslogoer automatisk.

Ofte samsvarer en konsensus -sekvens med et anerkjent proteinbindingssted.For nøyaktig å skildre sekvenser på genomet, brukes ofte matematiske formler.Disse inkluderer statistiske formler som logaritmer og numeriske verdier, som kan være positive eller negative, for å representere plasseringen av genetisk informasjon.Prosesser i genomet for normale biologiske funksjoner, så vel som de som er relatert til sykdommer, kan analyseres på denne måten.

De matematiske representasjonene av en konsensus -sekvens gir generelt en modell av DNA og aminosyremønstre.Et eksakt bilde er vanligvis ikke gitt.Sekvensene kan imidlertid hjelpe forskere med å relatere de funksjonelle aspektene ved forskjellige deler av genomet til evolusjonsmønstre av organismer.