Hva er en Contig?

En kontig, forkortelse for sammenhengende, refererer til enten et deoksyribonukleinsyre (DNA) segment eller produktet av overlappende segmenter som danner en kontinuerlig, omfattende, uavbrutt DNA -sekvens.Ved å studere kart over disse segmentene, er det mulig å oppdage rekkefølgen på segmenter som omfatter forskjellige sekvenser, og konturer kan legges til, fjernes eller omorganiseres for å danne nye sekvenser.DNA Contig -kartlegging og biblioteker gjør det muligOverlapping av matchende sekvensmerkede sett eller ved matching uttrykte sekvensmerker.Ved å forstå denne byggesteinprosessen som brukes av basene til DNA -segmenter, kan kontigs replikert eller klonet inn i ønskelige sekvenser, legge til eller eliminere mindre gunstige segmenter.Forskere ser på disse sekvensene som kart på svært detaljerte, datastyrte DNA -programmer.Programmet gir en visuell sammenbrudd av basene som brukes til å konstruere segmentene, og segmentene som brukes til å bygge bestemte sekvenser.Ved hjelp av forskjellige fargevalg viser forskjellige Contig -programmer denne informasjonen som lave, mellomstore og høykvalitetssekvenser.

Contig -kartlegging kaster ofte lys over årsakene til genetiske lidelser.Williams syndrom produserer for eksempel symptomer på flere systemer hos barn, inkludert kardiovaskulære problemer, forhøyede kalsiumnivåer i blodet og unnlatelse av å trives.Forskere oppdaget at sletting av bånd som påvirker visse gener, som kan være forårsaket av upassende overlapping av contigs.En annen genetisk barndomsforstyrrelse, CRI-DU-Chat-syndrom, produserer også flere symptomer, som hver forskere mener korrelerer med slettinger og unormal posisjonering.

Forskere analyserer også contig -sekvenser i plantearter.Hver plante inneholder sekvensering som er unik for den planten, og ved å skaffe kart over individuelle plantearter oppdager forskere lignende og varierende egenskaper som kan bidra til helse eller forverring av en bestemt plantetype.Ved å analysere Contig -segmenter og sekvenser i sykdommer som bærer organismer, kan leger bestemme egenskaper som deretter kan brukes i behandlingsutvikling.Kartlegging gir visuell innsikt i mulige genetiske manipulasjoner gjennom sekvens -sletting eller kloning.

Forskere kan vokse klonede DNA -prøver i bakterielt kunstig kromosom, gjær kunstig kromosom, eller i P1 eller fagfulle kromosommedier.Disse kromosomene inneholder hvor som helst fra 50 til hundretusener av baser, som kompilerer contig -segmenter.Etter en periode med kolonisering blir prøver ekstrahert ved bruk av en sprøyte og plassert i DNA -sekvenseringsgel, som gjennomgår elektroforese og tørker.En autoradiograf leser prøven og fingeravtrykk sekvensene.Forskere skanner deretter fingeravtrykket til en bildefil, som senere kan lastes inn i et Contig -program.