Hva er en kilobase?

En kilobase er en nummereringsmåling som brukes innen genetikk.Ettersom en base er en byggestein med genetisk informasjon, og hver organisme inneholder mange baser, er 1000 baser et vanlig tall å bruke når man diskuterer hvor mange baser et organismer genetisk bibliotek inneholder.Denne 1000 basebiter blir mer riktig omtalt som en kilobase.

Hver levende organisme inneholder genetisk informasjon.Denne informasjonen staver ut organismen nøyaktig hvilke proteinprodukter organismen trenger for å leve, vokse og multiplisere.All genetisk informasjon sammen kalles organismens genom.

Hvert genom er delt inn i diskrete seksjoner.Disse seksjonene, kalt gener, kode for et bestemt produkt.Hvert gen inneholder en streng med byggesteiner, kalt baser.Når organismen leser genene for å produsere et bestemt produkt, er det sekvensen av baser inne i genet som det leser.

Bare fire baser eksisterer i det genetiske materialet DNA.Dette er cytosin (C), guanin (G), tymin (T) og adenin (A).Det er rekkefølgen som basene er ordnet i et gen som dikterer hva det genet koder for.Kompleksiteten som er nødvendig for å produsere alle produktene som er viktige for menneskelivet, oppstår fra genene og antallet baser inne i dem.

Gener inneholder hver et bemerkelsesverdig antall baser.Hele menneskets genom inneholder for eksempel 3 milliarder baser, hver sammenkoblet med en annen base i en spiralhelixstruktur.Den store mengden baser som er til stede i et genom, betyr at genetikere synes det er lettere å referere til gener som å være x kilobaser i lengde, i motsetning til 1000 ganger x i lengde.

Selv de minste genomene, for eksempel Carsonella Ruddii bakterie genom, holder omtrent 160 000 basepar.Dette bittesmå genomet er omtrent 160 kilobaser (KB).Det menneskelige genomet er derimot 3 millioner kilobase par i lengde.

Sekvensering av genomer krever at genomet først blir brutt opp.Utstyr som utfører sekvensering kan bare håndtere så mange baser på en gang.Genetikere kan dele opp et genom i mange seksjoner og referere til dem som å inneholde så mange kilobase -par, for eksempel en lengde på 150 kilobase -par.Denne størrelsen på genetisk materiale kan være genetisk konstruert til en annen organisme for å multiplisere DNA opp til et nivå som er lett lesbart.Til og med disse relativt små DNA-delene er for lange til å sekvensere direkte, slik at genetikere da kan bryte opp et 150 kb-segment i mye mindre porsjoner av noen hundre baser i lengde.