Hva er en mikroarray?

En mikroarray er en sekvens av prikker av DNA, protein eller vev arrangert på en matrise for enkel samtidig analyse. Den mest kjente er DNA -mikroarray, som spiller en integrert rolle i genuttrykksprofilering. Substratmaterialet er glass, plast eller en silisiumbrikke. Alternative navn for DNA -mikroarray inkluderer gen chip , DNA -chip og biochip . De små DNA -bitene kalles sonder .

En mikroarray kan lages på en rekke måter. Det mest primitive er å bare slippe DNAet på glassglass ved hjelp av pinner. Mer sofistikerte teknikker bruker fotolitografi, elektrokjemiske tilnærminger og til og med blekkskriver - alt som kan levere DNA til et presist sted nøyaktig.

DNA -mikroarray er et produkt på slutten av 1980 -tallet og begynnelsen av 1990 -tallet, da bioteknologi virkelig begynte å ta av. Mikroarray lar en forsker utføre en sekvens av tester på alle prøvene samtidig, og fremskynder forskningsdramatically. Tradisjonell biologisk eksperimentering fungerer på ting om gangen. Probene er noen ganger merket med prikker som kalles fluorofores når de ikke lett kan bli fortalt fra hverandre.

Noen av de største mikroarrayene, laget av selskaper slike NimbleGen -systemer, inneholder så mange som 390 000 steder. Mikroarray brukes ofte til å analysere hele genomet til en organisme, som kan inneholde dusinvis av kromosomer eller mer, hver med sitt eget DNA og RNA. Dessverre er ikke alle mikroarrayer kompatible med hverandre, og det er en åpenbar mangel på standarder. Standardiseringsinnsats er i gang, men uten stor suksess ennå.

Som de fleste nyskapende bioteknologiske forskningsagendaer, kan tester på mikroarray produsere enorme datamengder, og gi opphav til feltet bioinformatikk , som søker å gi mening om det hele. Det kan eksistere funn og korrelasjoner somCH har vi allerede målt, men ganske enkelt ikke lagt merke til på grunn av overløpet av data. Data mining brukes mye for å analysere resultatene av disse komplekse eksperimentene.