Hva er et syntetisk peptid?

Peptider er organiske molekyler der flere aminosyrer er koblet sammen med peptidbindinger.Hver aminosyre har en annen sidekjede.Alle aminosyrer består av en aminogruppe, som er NH2, og en karboksylatgruppe, som er COOH.Når disse gruppene reagerer, oppretter de en peptidbinding.Når det utføres kjemisk utenfor cellen, er peptidet kjent som et syntetisk peptid.

Et dipeptid inneholder to aminosyrer og har en peptidbinding, mens et tripeptid har tre aminosyrer og to peptidbindinger.Konvensjonen er at aminosyrekjeder opptil 50 aminosyrer er kjent som peptider, mens de lenger er kjent som proteiner.Den største forskjellen i å lage et syntetisk peptid er at aminosyrene tilsettes fra karboksylatgruppene fremover.I celler starter ribosomene å syntetisere peptider med aminogruppen.

Den vanligste metoden for å lage syntetiske peptider er å bruke fastfase-peptidsyntese.Dette tillater dannelse av et syntetisk peptid som ikke ville forekomme i naturen, slik som de som inneholder unaturlige aminosyrer.Med denne metoden er peptidkjeder immobilisert på porøse perler.Aminosyrene blir behandlet med beskyttelsesgruppene FMOC eller BOC for å beskytte dem mot uønskede reaksjoner.

Peptidene gjennomgår gjentatte sykluser med kobling og avbeskyttelse.Når det ikke er beskyttet, har peptidet festet til den faste fasen en fri aminoterminal gruppe som er koblet til en nitrogenbeskyttet aminosyreenhet.Deretter blir denne enheten avbeskyttet og kan reagere ytterligere for å feste en annen aminosyre.Når peptidet er fullført, spaltes det fra harpiksen og renses ved omvendt fase HPLC.Prosessen som lager et syntetisk peptid kan utføres til en rekke selskaper.

Peptidsyntese utføres for en rekke forskningsmål.Noen forskere ønsker å bekrefte at de riktig har bestemt strukturen for naturlig forekommende peptider.Andre utfører struktur/funksjonsstudier på biologisk aktive proteiner og peptider.Slike peptider inkluderer hormoner og et antall giftstoffer.Ofte brukes syntetiske peptider som sonder for å studere de aktive delene av proteinmolekyler.

peptider er medvirkende til massespektrometri for å bidra til å identifisere om en forsker har isolert et bestemt protein.Hvert protein brytes ned i et mønster av unike peptider som kan oppdages ved massespektrometri.Prosessen med å lage antistoffer mot proteiner hos dyr har blitt mye enklere med bruk av peptidsyntese.Man trenger ikke å rense proteinet og bruke det til å generere antistoffer.Man kan syntetisere et peptid med et fragment av proteinet og deretter bruke det peptidet som kilde til antistoffene.

Et spesielt aktivt forskningsområde på syntetiske peptider innebærer å utvikle nye terapeutiske teknikker, for eksempel nye vaksiner.Peptidsyntese brukes til å generere biblioteker med peptider for å screene for deres biologiske egenskaper.Celle-penetrerende peptider er utviklet som kan introdusere forskjellige faktorer i celler, inkludert peptider, proteiner og byggesteinene til DNA.Slike teknikker har stort potensiale som medikamentleveringssystemer.