Hva er en sinkfinger?

En sinkfinger er en fingerformet proteinfold som dannes av spesifikke aminosyrer i proteinbindingen til et sinkion.Disse proteinene binder seg ofte til DNA og RNA fordi deres form tillater nær interaksjon av domenet med nukleotidene av DNA og RNA.Deres nukleotidbindende egenskaper lar dem fungere i regulering av genuttrykk og i virusmontering.

Det er flere typer sinkfingerstrukturer, men den vanligste versjonen består av en alfa -helix og et beta -ark, de to vanligste sekundære strukturer i proteiner, på hver side av minst en sinkion.Alfa -helix- og betaarket holdes på plass av cystin- og histidinrester, og koordinerer sinkionet via deres nitrogen- og svovelatomer.Sinkfingeren binder seg til DNA, og gjennom samspillet mellom aminosyrer i periferien med basepar i midten av DNA -dobbelthelixen.Det er et kompakt proteindomene, og dens lille størrelse gjør at det har nærhet med DNA -basepar.

Disse proteinene er de vanligste transkripsjonsfaktorene i levende organismer.En transkripsjonsfaktor er et protein som binder seg til DNA og kontrollerer overføringen av genetisk informasjon til RNA.Det faktum at disse proteinene for å målrette DNA har gjort dem til kandidater til målrettet ombygging for å målrette DNA-sekvenser av interesse.

.ZFN kan brukes til å kutte DNA på bestemte steder, og er et nyttig verktøy for å fremme stedsspesifikk rekombinasjon av DNA.Konstruerte sinkfingre kan også brukes som kunstige transkripsjonsfaktorer. sinkfingerdomener finnes i noen virale proteiner, inkludert neocapsid (NC) -proteinet fra det humane immunsvikt-1 (HIV-1) viruset.NC er et attraktivt antiviralt mål fordi det er viktig for virusmontering og er sterkt bevart.Inhibitorer som spesifikt er målrettet mot sinkfingrene til virale og retrovirale proteiner, kan brukes for å forhindre virusreplikasjon.Å oppnå antivirale forbindelser av denne art er et aktivt område av biomedisinsk forskning. Disse proteinene spiller viktige roller i den normale metabolismen av celler.For å være effektiv, må anti-retrovirale forbindelser spesifikt målrette retrovirale sinkfingerproteiner.Disse retrovirale proteiner har distinkte aminosyresekvenser og strukturelle forskjeller fra cellulære sinkfingerproteiner, så å oppnå selektive hemmere er et oppnåelig mål.