Hva er en endopeptidase?

En endopeptidase er en type protease, et enzym fra en stor gruppe som nedbryter proteiner.Enzymer er proteiner som får reaksjoner til å skje mye raskere.Proteiner består av kjeder av aminosyrer, koblet med peptidbindinger.Denne koblingen kobler karboksylterminalen til en aminosyre med amineterminalen til den neste.Endopeptidaser spalter peptidbindingene til aminosyrene i proteinet, i motsetning til exopeptidaser , som spalter i endene av proteinet.

Endopeptidaser finnes i alle klasser av organismer og har et bredt spekter av biologiske aktiviteter.De er involvert i fordøyelsen av protein i mat.Dette inkluderer enzymene pepsin, trypsin og chymotrypsin.Proteaser er også involvert i cellulær signalering ved å bryte ned andre proteiner, som antistoffer eller hormoner.De kan slå av stier av eller på.

Proteaser er vanligvis først laget som et større molekyl som er inaktivt.Dette beskytter cellen som syntetiserer den fra å bli skadet.Når proteasen er levert til målet, for eksempel magen, fjernes et stykke av molekylet.Dette aktiverer proteasen.

På grunn av deres utall roller i cellulær funksjon, er det mye medisinsk interesse for endopeptidase -aktivitet.Et eksempel på dette er prolylendopeptidase, som spalter spesielt etter aminosyreprolinen.Det har vært assosiert med psykologiske lidelser, som depresjon, mani og schizofreni.Det er klinisk interesse for prolylendopeptidase-hemmere som mulige antidepressiva.

Et annet eksempel er nøytral endopeptidase, som har flere andre navn.Det er også kjent som neprilysin og vanlig akutt lymfoblastisk leukemi -antigen (Calla).Denne proteasen nedbryter små utskilte peptider, inkludert peptidet som har blitt implisert som en årsak til Alzheimers sykdom, og flere viktige signalpeptider.Nøytral endopeptidase brukes noen ganger som en kreftmarkør, men dens rolle i kreft er uklar.Inhibitorer er utviklet for å hjelpe til med smertelindring og kontroll av høyt blodtrykk.

Endopeptidasene plasseres i forskjellige familier, avhengig av strukturen på deres aktive sted og forholdene de foretrekker.Det er serinproteaser, som har aminosyreserinen på deres aktive sted.Medlemmer av denne familien inkluderer fordøyelsesproteaset trypsin og chymotrypsin, sammen med prolyl endopeptidase.En hemmer som ofte brukes i biokjemiske forskningslaboratorier, er den svært giftige forbindelsen fenylmetanesulfonylflouride (PMSF).Det brukes under proteinisolering og rensing for å hemme serinproteaseaktivitet, noe som kan nedbryte proteinet som blir renset.

Cysteinproteaser har en svovelgruppe på deres aktive sted og er vanlig i frukt.Disse enzymene finnes i kjøttanbudsmidler.Papain er et eksempel på en slik endopeptidase og brukes til å behandle bie- og vepsestikk.

Det aktive stedet for aspartiske proteaser inneholder vanligvis to aspartatgrupper.Metalloendopeptidaser krever en metallkofaktor for aktivitet.Nøytrale endopeptidaser er en del av denne familien, og krever sink for aktivitet.