Co to jest analiza mikromacierzy?

Analiza mikromacierzy DNA jest stosowana w biologii molekularnej i medycynie diagnostycznej w celu ustalenia, które geny w komórce są włączone w określonym momencie.Ta technika jest znana jako test multipleksowy, ponieważ może mierzyć tysiące próbek w jednym teście.Techniki mikroanalizy DNA są stosowane do interpretacji danych z testów przeprowadzonych na RNA, a także DNA, w zależności od konkretnych wymagań eksperymentu.

Podstawą analizy mikromacierzy DNA jest wysoka swoistość cząsteczek DNA i zdolność do wyboru unikalnegoSekwencje DNA reprezentujące określony gen.Eksperyment z analizy mikromacierzy przeprowadzany jest na stałej powierzchni wykonanej z szklanego lub silikonowego układu, na którym jest matryca chemiczna.Na powierzchni matrycy DNA lub sondy RNA ustawiono ustawione w uporządkowanych rzędach.

Po skonfigurowaniu układu z wymaganymi sondami przygotowywane są komórki.Aby przygotować komórki, należy je otworzyć, aby można było izolować zawarte kwasy nukleinowe.Seria odczynników dodaje się w celu ekstraktu i koncentrowania kwasów nukleinowych zawartych w komórkach.Następnie do chipu dodaje się ekstrakt z kwasu nukleinowego, który następnie pozostaje na kilka godzin, aby umożliwić czas interakcji sond i wiązanie się z komórkowymi kwasami nukleinowymi.Wreszcie do układu Chip dodaje się kolejną serię odczynników w celu zidentyfikowania lokalizacji, w których komórkowe kwasy nukleinowe związały się z sondami. Następnie stosuje się analizę mikromacierzy

Analiza mikromacierzy do ustalenia, które sondy były w stanie wykryć komórkowe kwasy nukleinowe.Jest to często złożona analiza, ponieważ jeden pojedynczy układ może zawierać dziesiątki tysięcy unikalnych sond.Kolejność sond na układie jest przechowywana w komputerowej bazie danych, aby można było łatwo uzyskać wyniki.Korzystając z układu i bazy danych, naukowca może opracować listę genów związanych z sondami, a zatem były obecne w oryginalnym ekstrakcie komórkowym.

Technika analizy mikromacierzy jest powszechnie stosowana w profilowaniu ekspresji genów.W tego rodzaju eksperymencie mikromacierz jest ustawiany w celu zbadania wzorców ekspresji genów w komórkach.Sondy dla przedmiotowych genów są zawarte w mikromacierze, a po zakończeniu eksperymentu analiza danych mikromacierzy może określić, który z badanych genów został włączony w określonym czasie.

Inne zastosowania tej techniki obejmują porównawczą hybrydyzację genomową i wykrywanie SNP.Porównawcza hybrydyzacja genomowa jest testem, który analizuje zawartość genomową w komórkach powiązanych organizmów.Ten rodzaj testu zawiera informacje na temat relacji genetycznych między różnymi gatunkami.

Wykrywanie SNP jest techniką, którą można zastosować w analizie kryminalistycznej, analizie powiązań genetycznych i oceny ryzyka choroby genetycznej.SNP są polimorfizmami pojedynczymi nukleotydami, lokalizacjami genomu, w których istnieją dwie możliwe sekwencje pary podstawowe.SNP może dostarczyć szeregu przydatnych informacji genetycznych ze względu na fakt, że istnieją różne różnice SNP w różnych populacjach etnicznych i geograficznych.