W biologii jaka jest sekwencja konsensusu?

Sekwencja konsensusowa jest zestawem białek lub nukleotydów w kwasie deoksyrybonukleinowym (DNA), które pojawiają się regularnie.Aminokwasy adenina, guanina, cytozyna i tyminowa tworzą sekwencje genetyczne w DNA.Biolodzy molekularni często wykorzystują statystyki do przewidywania, gdzie będzie ich pewna sekwencja, lub do zrozumienia, gdzie wiążą się poszczególne cząsteczki.Tam, gdzie sekwencje aminokwasowe pozostają takie same i gdzie mają tendencję do różnic, może być reprezentowany przez wzór.W przypadku konsensusowej sekwencji promotora konkretny rodzaj enzymu może wiązać się z miejscami podobnie sekwencjonowanych białek.

Genetycy, podobnie jak naukowcy w wielu dyscyplinach naukowych, często stosują podstawienia do uproszczenia złożonych systemów.W organizmie jest tak wiele podstaw i genów aminokwasowych, że naukowcy nie mogą ich policzyć, chyba że istnieje jakiś ogólny system.Sekwencja konsensusu może pojawić się w wielu lokalizacjach w DNA, a także w różnych żywych rzeczach.Podobieństwa i różnice, które zwykle występują, mogą być wskazane przez formułę.

Statystycznie naukowcy mogą klasyfikować sekwencje genetyczne w celu poszukiwania wzorów.Powtarzające się wzorce, zwane motywami sekwencji, są ogólnie stosowane do reprezentowania obszarów genetycznych, które kontrolują określone procesy biologiczne.Sekwencje konsensusowe mogą również oferować wgląd w sposób syntetyzowania białek lub w jaki sposób cząsteczki kierowane są w komórce.

W notacji sekwencji konsensusowej lokalizacja niektórych nukleotydów może wykazać, że zawsze znajdują się w reprezentowanym miejscu.Można również wskazać, że może tam być jeden nukleotyd lub inny.W tym przypadku, jak często pojawia się aminokwas, zamiast innego, na ogół nie jest określony.Model graficzny jest czasem używany do wskazania tej częstotliwości poprzez zwiększenie lub zmniejszenie wielkości symboli.Niektóre oprogramowanie mogą automatycznie generować logo sekwencji.

Często sekwencja konsensusowa pasuje do rozpoznanego miejsca wiązania białka.Aby dokładnie przedstawić sekwencje genomu, często stosuje się formuły matematyczne.Obejmują one formuły statystyczne, takie jak logarytmy i wartości numeryczne, które mogą być dodatnie lub negatywne, w celu przedstawienia lokalizacji informacji genetycznych.Procesy w genomie dla normalnych funkcji biologicznych, a także te związane z chorobami, można w ten sposób analizować.

Matematyczne reprezentacje sekwencji konsensusowej ogólnie stanowią model wzorów DNA i aminokwasów.Dokładny obraz zazwyczaj nie jest dostarczany.Sekwencje mogą jednak pomóc naukowcom powiązać funkcjonalne aspekty różnych części genomu z ewolucyjnymi wzorcami organizmów.