Co to jest kontig?

Contig, krótki dla ciągłego, odnosi się do segmentu kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA) lub produktu nakładających się segmentów, które tworzą ciągłą, obszerną, nieprzerwaną sekwencję DNA.Badając mapy tych segmentów, możliwe jest odkrycie kolejności segmentów zawierających różne sekwencje, a kontigaty można dodawać, usuwać lub zmienić, aby utworzyć nowe sekwencje.DNA Contig Mapowanie i biblioteki pozwalają badaczom na identyfikację wyrównania, które mogą powodować chorobę, zapewnić lepsze zrozumienie, w jaki sposób komórki reagują w określonych warunkach i umożliwiają klonowanie korzystnych cech w organizmach żywych.Nakładanie się pasujących zestawów sekwencji lub przez pasujące znaczniki sekwencji wyrażanych.Zrozumienie tego procesu budulcowego stosowanego przez podstawy segmentów DNA, kontryty mogą replikować lub sklonować do pożądanych sekwencji, dodając lub eliminując mniej korzystnych segmentów.Naukowcy postrzegają te sekwencje jako mapy bardzo szczegółowych, skomputeryzowanych programów DNA.Program zapewnia rozkład wizualny podstaw używanych do budowy segmentów oraz segmentów używanych do budowy poszczególnych sekwencji.Korzystając z różnych schematów kolorów, różne programy Contig wyświetlają te informacje jako niskie, średnie i wysokiej jakości sekwencje.

Contig Mapowanie często rzuca światło na przyczyny zaburzeń genetycznych.Na przykład zespół Williamsa wywołuje objawy wielostronne u dzieci, w tym problemy sercowo-naczyniowe, podwyższony poziom wapnia we krwi i brak prosperowania.Naukowcy odkryli, że usunięcia pasma wpływają na niektóre geny, które mogą być spowodowane niewłaściwym nakładaniem się kontigów.Inne genetyczne zaburzenie dzieciństwa, zespół CRI-DU-Chat, również wytwarza wiele objawów, z których każdy według naukowców koreluje z delecjami i nieprawidłowym pozycjonowaniem.

Badacze analizują również sekwencje kontig u gatunków roślin.Każda roślina zawiera sekwencjonowanie unikalne dla tej rośliny, a poprzez uzyskanie map poszczególnych gatunków roślin naukowcy odkrywają podobne i różne cechy, które mogą przyczyniać się do zdrowia lub pogorszenia określonego rodzaju rośliny.Analizując segmenty i sekwencje kontig w organizmach przenoszących choroby, lekarze mogą określić cechy, które można następnie zastosować w rozwoju leczenia.Mapowanie zapewnia wizualny wgląd w możliwe manipulacje genetyczne poprzez usunięcie sekwencji lub klonowanie.

Naukowcy mogą wyhodować sklonowane próbki DNA w bakteryjnym sztucznym chromosomie, sztucznym chromosomie drożdżowym lub w pożywkach sztucznych chromosomów P1 lub fagu.Te chromosomy zawierają od 50 do setek tysięcy baz, które opracowują segmenty kontig.Po okresie kolonizacji próbki są ekstrahowane za pomocą strzykawki i umieszczane w żelu sekwencjonowania DNA, który ulega elektroforezie i wyschnięciom.Autoradiograf czyta próbkę i odciski palców sekwencji.Następnie naukowcy skanują odcisk palca w pliku obrazu, który później można załadować do programu Contig.