Co to jest retrotranspozon?

Transpozony to elementy DNA, które są mobilne lub mogą przenosić się do różnych miejsc w ramach informacji genetycznej komórki.Przechodząc do nowej lokalizacji w genomie komórki, transpozony mogą powodować mutacje, a także zmieniać ilość DNA znalezionego w komórce.Są one również określane jako geny skakania i są grupowane w dwie kategorie, które są transpozonami klasy II i transpozonów klasy I lub retrotranspozonów.Różnica między tymi dwiema klasami ma związek z tym, jak się poruszają;Retrotranspozon ma dwuetapowy proces ruchu.

Metoda ruchu segmentu DNA jest sposób, w jaki transpozony są klasyfikowane do każdej kategorii.Transpozon klasy II to kawałek DNA, który przenosi się z jednego miejsca do drugiego.Ruch transpozonu klasy I lub retrotranspozona jest znacznie bardziej złożony i obejmuje dwa etapy ruchu segmentu DNA.

Pierwszym krokiem do ruchu retrotranspozonu jest stworzenie segmentu RNA przez transkrypcjękawałka DNA.RNA ma teraz swobodę poruszania się po genomie, ponieważ nie jest powiązany z pasmem DNA.Gdy RNA dociera do nowej lokalizacji, specyficzny enzym, zwany odwrotną transkryptazą, tworzy nową nici DNA opartą na segmencie RNA.Ten nowy kawałek DNA jest następnie przymocowany do nowej lokalizacji w genomie.

Gdy retrotranspozon jest transkrybowany z powrotem do segmentu DNA z kopii RNA, zwykle ma długoterminowe powtórzenia (LTR) na końcu sekwencji DNA.LTR składają się z powtarzających się sekwencji zasad, które mogą mieć setki, a nawet tysiące baz.Zwykle otaczają funkcjonalną część DNA, taką jak gen, i są niezbędne do przymocowania segmentu DNA do oryginalnej nici DNA.LTR to jeden ze sposobów, w jaki naukowcy mogą rozpoznać, że odcinek DNA zawiera retrotranspozon.Uważa się, że około 42% całego ludzkiego genomu składa się z retrotranspozonów.

Ze względu na fakt, że nowe kopie DNA są wytwarzane przez odwrotną transkrypcję RNA, dodanie retrotranspozonu jest sposobem na zwiększenie ilości DNA DNAznalezione w jednej komórce.Jeśli retrotranspozon jest wstawiany do genu lub w pobliżu genu, może to spowodować mutację.Mutacje są zasadniczo zmianami sekwencji DNA i mogą mieć pozytywny, negatywny lub brak wpływu na genom, w zależności od zmiany sekwencji DNA.