Co to jest adnotacja genomu?

Genom adnotacja taguje sekcje genomu z informacjami o danych genetycznych, które zawiera.Jest to część procesu w Genome Projects, w której celem nie jest tylko sekwencjonowanie DNA docelowego organizmu, ale także zrozumienie, co robi i jak funkcjonuje.Naukowcy mogą przeprowadzać adnotację w swoich laboratoriach i mogą udostępniać dane innym naukowcom w celu gromadzenia zasobów i informacji.Dostępne są internetowe bazy danych otwarte dla publiczności, a niektórzy pozwalają członkom ogółu społeczeństwa na przesłanie własnych adnotacji.

Pierwszym krokiem w adnotacji genomu jest sekwencjonowanie, w którym badacze określają kolejność aminokwasów w DNA organizmów.Sekwencjonowanie całego genomu zajmuje dużo czasu i często zaczyna się adnotacjami przed dekodowaniem genomu.Z sekcją zsekwencjonowanego DNA w ręku badacz może zacząć adnotację.Naukowcy mogą zauważyć, gdzie geny wydają się zaczynają i zatrzymują, zwracając uwagę na charakterystyczne struny DNA, które zawierają informacje o funkcji genomu.

Komputery są w stanie samodzielnie wykonać adnotację genomu.Mogą uwzględniać znane wzory, takie jak struny aminokwasów, które pojawiają się na początku i na końcu genów.W zautomatyzowanej adnotacji komputer może dodawać notatki do różnych sekcji serii DNA, aby dostarczyć informacji na ten temat.Możliwe jest również porównanie segmentów z różnych organizmów w celu poszukiwania wariancji, która może dostarczyć ważnych informacji o gatunku jako całości.

Ręczne adnotacja genomu obejmuje fizyczne przegląd DNA.Wielu badaczy używa komputerów do wyświetlania informacji i oznaczania ich, umożliwiając im wprowadzenie ich do baz danych podczas ich pracy.W niektórych przypadkach recenzja ręczna może być konieczna po zautomatyzowanej adnotacji, aby upewnić się, że komputer poprawił informacje.Może to być żmudny proces i wystąpić błędy, co jest jednym z powodów, dla których badacze lubią gromadzić bazy danych.Jeśli adnotacja nie pasuje do innych w tej samej części DNA, ludzie mogą ocenić informacje w celu ustalenia, co się stało, i naprawić błąd.

Nie zawsze jest możliwe ustalenie, co robi gen podczas procesu adnotacji genomu.Naukowcy mogą oznaczać geny i oddzielić je od innych składników genomu, takich jak niekodujące DNA, takie jak powtórzenia.Informacje te można wykorzystać w badaniach, ponieważ ludzie rozwijają teorie o różnych segmentach genomu.Mogą dodać do adnotacji, aby zwrócić uwagę na funkcję genu.