Vad är en genom webbläsare?
En genom webbläsare är ett webbgränssnitt som används för att se den fysiska kartan över en kromosom.Denna karta visar hur mycket DNA som skiljer två gener, mätt i baspar.Mänskliga kromosomer varierar i storlek från 50 miljoner till över 250 miljoner baspar.En genom webbläsare visar schematiska representationer av hela kromosomer såväl som zoomade i schematik av enstaka gener och till och med den faktiska basparets sekvens.
En genomwebbläsare gör att användaren kan bläddra över en kromosom och zooma in på vissa platser.Många genom webbläsare tillåter användaren att zooma in på nivån för att se den faktiska DNA -sekvensen, även om den verkliga användbarheten hos en webbläsare är i förmågan att se gener i deras större sammanhang, snarare än att se DNA -sekvensen på nukleotidnivån.Den genomsnittliga storleken på en gen är 3 000 baspar, så när de zoomas in på basparnivån kommer användaren att se mindre än en hel gen.Den största humana genen, dystrofin, är 2,4 miljoner baspar långa.
Förutom att se schematiska representationer av gener, kan genom webbläsare också visa annan användbar information.Detta kan inkludera den del av genen som översätts till protein, kallad mRNA, och DNA -sekvenser som har andra funktioner än kodning för protein.Genom webbläsaren kan också visa vilka segment av DNA som användes i processen för att sekvensera genomet.
Ett stort antal organismer har sekvenserade genom.Det finns ingen enda webbläsare som är standard för genomiska fältet, så genom webbläsare kan variera mellan sekvenserade genom.Genom webbläsare har funktionen att kunna söka efter gener eller sekvenser av intresse, vilket gör att användaren kan hoppa från en genomisk plats till en annan.Det skulle inte vara effektivt att bläddra över en kromosom för att komma till en plats av intresse, på grund av den mycket stora storleken på de flesta kromosomer.
Vissa genom webbläsare har verktyg som kallas gen -sorterare.Detta verktyg visar en tabell över gener som är relaterade till varandra.Förhållandet kan vara en av flera typer: sekvenshomologi, liknande uttrycksprofil eller genomisk närhet.Användaren söker efter en gen som använder ett ord eller en fras, väljer den typ av relation han eller hon vill ha, och genens sorterare visar resultaten av sökningen.