Vad är en kontig?

Ett kontig, kort för sammanhängande, hänvisar till antingen ett deoxyribonukleinsyra (DNA) -segment eller produkten av överlappande segment som bildar en kontinuerlig, omfattande, oavbruten DNA -sekvens.Genom att studera kartor över dessa segment är det möjligt att upptäcka ordningen på segment som består av olika sekvenser, och contigs kan läggas till, tas bort eller omorganiseras för att bilda nya sekvenser.DNA Contig -mappning och bibliotek gör det möjligt för forskare att identifiera justeringar som kan orsaka sjukdomar, ge en bättre förståelse för hur celler reagerar under vissa förhållanden och möjliggör förmågan att klona gynnsamma egenskaper i levande organismer.

Genomiska kontig är kopplade till en annan avÖverlappande av matchande sekvens -taggade uppsättningar eller genom att matcha uttryckta sekvenstaggar.Genom att förstå denna byggstensprocess som används av baserna i DNA -segment kan contigs replikeras eller klonas i önskvärda sekvenser, lägga till eller eliminera mindre gynnsamma segment.Forskare ser dessa sekvenser som kartor på mycket detaljerade, datoriserade DNA -program.Programmet ger en visuell uppdelning av baserna som används för att konstruera segmenten och de segment som används för att bygga särskilda sekvenser.Med hjälp av olika färgscheman visar olika contig -program denna information som låg, medelstora och högkvalitativa sekvenser.

Kontigkartläggning belyser ofta ljuset på orsakerna till genetiska störningar.Williams syndrom producerar till exempel multisystemsymtom hos barn, inklusive hjärt-kärlproblem, förhöjda blodkalciumnivåer och misslyckande med att trivas.Forskare upptäckte banddeletioner som påverkar vissa gener, vilket kan orsakas av olämplig överlappning av contigs.En annan genetisk barndomsjukdom, Cri-Du-CHAT-syndrom, producerar också flera symtom, som var och en forskare tror att korrelerar med borttagningar och onormal positionering.

Forskare analyserar också contig -sekvenser i växtarter.Varje växt innehåller sekvensering som är unik för den växten, och genom att få kartor över enskilda växtarter upptäcker forskare liknande och varierande egenskaper som kan bidra till hälsa eller försämring av en viss växtyp.Genom att analysera kontigsegment och sekvenser i sjukdomar som bär organismer kan läkare bestämma egenskaper som sedan kan användas i behandlingsutvecklingen.Kartläggning ger visuell insikt i möjliga genetiska manipulationer genom sekvensavdelningar eller kloning.

Forskare kan odla klonade DNA -prover i bakteriell konstgjord kromosom, jäst konstgjord kromosom eller i P1 eller fag konstgjorda kromosommedier.Dessa kromosomer innehåller var som helst från 50 till hundratusentals baser, som sammanställer kontigsegment.Efter en koloniseringsperiod extraheras prover med användning av en spruta och placeras i DNA -sekvenseringsgel, som genomgår elektrofores och torkar.En autoradiograf läser provet och fingeravtryck sekvenserna.Forskare skannar sedan fingeravtrycket i en bildfil, som senare kan laddas in i ett kontigprogram.