Vad är en kilobase?

Ett kilobas är en numreringsmätning som används inom genetikområdet.Eftersom en bas är en byggsten av genetisk information, och varje organisme innehåller många baser, är 1 000 baser ett vanligt antal att använda när man diskuterar hur många baser en organismer som genetiskt bibliotek innehåller.Denna 1 000 basbit kallas mer korrekt som en kilobas.

Varje levande organisme innehåller genetisk information.Denna information stavar ut till organismen exakt vilka proteinprodukter organismen behöver för att leva, växa och multiplicera.All den genetiska informationen tillsammans kallas organismens genom.

Varje genom delas upp i diskreta sektioner.Dessa avsnitt, kallade gener, kod för en viss produkt.Varje gen innehåller en rad byggstenar, kallade baser.När organismen läser generna för att producera en viss produkt är det sekvensen av baser inuti genen som den läser.

Endast fyra baser finns i det genetiska materialet DNA.Dessa är cytosin (C), guanin (G), tymin (T) och adenin (A).Det är i vilken ordning baserna är ordnade i en gen som dikterar vad den genen kodar för.Den komplexitet som krävs för att producera alla produkter som är viktiga för människoliv uppstår från längden på generna och antalet baser inuti dem.

Gener innehåller vardera ett anmärkningsvärt antal baser.Hela mänskliga genomet innehåller till exempel 3 miljarder baser, var och en parade med en annan bas i en spiralhelixstruktur.Den stora mängden baser som finns i ett genom innebär att genetiker tycker att det är lättare att hänvisa till gener som x kilobaser i längd, i motsats till 1 000 gånger x i längd.

Till och med de minsta genomerna, såsom Carsonella ruddii bakteriegenom, har cirka 160 000 baspar.Detta lilla genom är cirka 160 kilobaser (KB) i längd.Det mänskliga genomet är å andra sidan 3 miljoner kilobaspar i längd.

Sekvensering av genom kräver att genomet först bryts upp.Utrustning som utför sekvenseringen kan bara hantera så många baser på en gång.Genetiker kan dela upp ett genom i många sektioner och hänvisa till dem som innehåller så många kilobaspar, till exempel en längd på 150 kilobaspar.Denna storlek på genetiskt material kan genetiskt konstrueras till en annan organisme för att multiplicera DNA upp till en nivå som är lätt läsbar.Även dessa relativt små DNA-bitar är för långa för sekvensering direkt, så genetiker kan sedan bryta upp ett 150 kb-segment i mycket mindre delar av några hundra baser i längd.