Vad är ett peptidantigen?

Ett peptidantigen är användningen av en peptid för att utlösa ett djurens immunsystem för att utveckla antikroppar mot den peptiden.Peptider är korta strängar av aminosyror;Längre kedjor är kända som proteiner.Ett peptidantigen kan användas som en del av utvecklingen av ett vaccin.

Peptider är organiska molekyler som består av kväve, syre, kol, väte och vanligtvis svavel.De är kedjor av aminosyror och är kopplade av en peptidbindning.Peptidbindningar är kopplingar av NH2- och COOH -grupperna i de två aminosyrorna intill varandra.

Ett antigen är en molekyl som binder till en antikropp och genererar ett immunsvar, kroppens reaktion på molekyler som verkar vara främmande.Inte alla typer av molekyler kan erkännas av immunsystemet.Proteiner, peptider och kedjor av sockerarter kan fungera som antigener.

Det finns också humana antigener.Dessa inkluderar proteiner som finns på ytan av tumörceller.Sådana antigener kan också vara närvarande i blodet.Detta är grunden bakom prostratspecifik antigentestning, som vanligtvis används för att screena för prostratcancer.Vissa antigener introduceras avsiktligt för att fungera som vacciner och generera ett immunsvar.

Antikroppar är proteiner i blodet som motverkar ett specifikt antigen.Endast vissa delar av en molekyl känns igen av en antikropp.Spetsen på antikroppen innehåller en paratop som känner igen den komplexa strukturen hos antigenet.Denna region i antikroppen ansvarar för den stora mångfalden av antikroppar som finns i en organisme.En individ kan ha miljoner olika antikroppar.

Ofta används peptidantigener eftersom de är en del av ett större protein, vilket kanske inte har renats.När man använder ett peptidantigen för att göra antikroppar är det viktigt att en forskare använder en antigenisk del av peptiden.Antigenspecialister kan hjälpa till med antigendesign för att maximera chansen att peptiden som används som antigen kommer att generera en antikropp.Det är mycket lättare att förutsäga vilka epitoper som utsätts om man har kunskap om föreningens tredimensionella struktur.

I de flesta fall finns det ingen kunskap om den övergripande strukturen i peptiden, även om prediktiv programvara kan analysera vilken del av peptiden som sannolikt kommer att vara antigena.De peptider som troligtvis stöter på en antikropp är de på ytan av cellen.De kommer sannolikt att vara hydrofila mdash;löslig i vatten.Flexibilitet är också ett viktigt kriterium för ett peptidantigen att reagera med en epitop.

När ett lämpligt peptidantigen har identifierats skapas en syntetisk peptid.Det kan sedan användas vid immunisering.Det injiceras i ett djur för att generera ett immunsvar.När antikropparna har isolerats analyseras de för att säkerställa att organismen har monterat ett effektivt immunsvar.

Ett vanligt sätt att testa för att se om antikroppar är specifika för önskat protein är att utföra en Western blot.Detta innebär att separera proteinerna som innehåller peptiden på en gel med användning av en elektrisk ström.Detta kallas elektrofores.Sedan överförs proteinerna till ett membran och undersöks med antikroppen.

Om det finns antikroppsspecifikt för proteinet kommer det att binda till proteinet på membranet.Membranet tvättas och behandlas sedan med en sekundär antikropp.Om antikropparna utvecklades i en mus, till exempel, skulle den sekundära antikroppen vara en anti-musantikropp.Denna antikropp är konstruerad för att generera färg eller luminescens så att forskaren kan se var den ursprungliga antikroppen har bunden.