Vad är ett transkriptom?

Transkriptomet är en komplett samling RNA från en organisme, en grupp celler eller till och med en specifik cell.RNA syntetiseras från DNA genom en process som kallas transkription.RNA som finns i en cell och kroppen bestämmer vilka gener som kommer att uttryckas, och det förändras under en organismernas liv, till skillnad från DNA, som förblir statisk.Miljötrycket är ett av de ledande orsakerna till förändringar, eftersom kroppen försöker anpassa sig till förändrade miljö situationer för att hålla sig fungera.

Transkriptomet är mycket mindre än ett organismergenom, den kompletta samlingen av DNA i organismen.Sätt i enkla termer, kan man tänka på DNA som en kokbok och lista en komplett samling recept som kan göras.Transkriptomet är koden som avgör vilka recept som kommer att göras och när.Kokboken förblir statisk under hela livet, medan transkriptomet förändras som svar på miljöfaktorer.

En viktig del av transkriptomet är mRNA -molekyler.Messenger RNA är RNA som kommunicerar med ribosomerna i cellerna för att rikta cellerna att göra olika proteiner.Dessa proteiner används för en mängd olika funktioner.Andra delar kanske inte direkt kodar för proteinproduktion, men gör saker som att bestämma cellstruktur och reglera genuttryck.Tillsammans håller de olika komponenterna i transkriptomet en organisme fungerar och bestämmer genuttryck inom den organismen.

Inom olika celler i kroppen kan transkriptomet vara mycket annorlunda.Leverceller har till exempel RNA som gör dem leverceller och säkerställer att cellerna utför nödvändiga funktioner.Hudceller har å andra sidan ett annat transkriptom som aktiverar de gener som är nödvändiga för att göra en cell till en hudcell.Både lever- och hudceller har en fullständig kopia av genomet, men deras transkriptomer avgör vilka delar av genomet som är aktiverade.

Precis som med DNA är det möjligt att sekvensera RNA.Transkriptomsekvensering kan göras för att lära sig mer om handlingarna från en cell och värdorganismer DNA och för att identifiera de platser där uttrycket av genetisk information går fel.När en levercell blir malig, till exempel, beror det på att transkriptomet inte fungerar som den borde vara, och gener för malignitet har aktiverats, eller cellerna saknar reglering på något sätt, vilket får dem att växa ut ur kontroll.Sekvensering av RNA i en malign cell kan hjälpa en forskare att ta reda på vilken gen som aktiverades eller inaktiverades för att orsaka maligniteten.