Vad är Genome Annotation?

Genomannoneringstaggar av ett genom med information om de genetiska data som den innehåller.Detta är en del av processen vid genomprojekt, där målet inte bara är att sekvensera DNA från en målorganism, utan att förstå vad det gör och hur det fungerar.Forskare kan utföra kommentarer i sina labb och kan dela data med andra forskare för att samla resurser och information.Online -databaser som är öppna för allmänheten är tillgängliga, och vissa tillåter också medlemmar av allmänheten att lämna in sina egna kommentarer.

Det första steget i genomanteckningen är sekvensering, där forskare bestämmer ordningen på aminosyror i ett organismer DNA.Att sekvensera ett helt genom tar lång tid, och det är vanligt att forskare börjar kommentera innan genomet har avkodats.Med ett avsnitt av sekvenserat DNA i handen kan en forskare börja kommentera.Forskare kan notera var gener verkar starta och stoppa och uppmärksamma distinkta strängar av DNA som innehåller information om genomens funktion.

Datorer kan utföra en viss genomanteckning på egen hand.De kan söka kända mönster, till exempel strängar av aminosyror som visas i början och slutet av gener.Vid automatiserad kommentar kan datorn lägga till anteckningar till olika delar av en sträng av DNA för att ge information om det.Det är också möjligt att jämföra segment från olika organismer för att leta efter varians som kan ge viktig information om arten som helhet.

Manuell genomanteckning innebär fysiskt granskning av DNA.Många forskare använder datorer för att visa informationen och tagga den, så att de kan ange den i databaser när de fungerar.I vissa fall kan en manuell granskning vara nödvändig efter automatiserad kommentar för att se till att datorn fick informationen korrekt.Detta kan vara en noggrann process och fel uppstår, vilket är en anledning till att forskare gillar att samla databaser.Om en kommentar inte matchar andra på samma avsnitt av DNA, kan människor utvärdera informationen för att avgöra vad som hände och fixa felet. Det är inte alltid möjligt att bestämma vad en gen gör under genomnoteringsprocessen.Forskare kan flagga gener och separera dem från andra komponenter i genomet, såsom icke-kodande DNA som upprepningar.Denna information kan användas i forskning när människor utvecklar teorier om olika segment av genomet.De kan lägga till kommentarerna för att notera funktionen för en gen.